83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4259 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  32.32 
 
 
1575 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  31.8 
 
 
1642 aa  734    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  32.67 
 
 
1606 aa  688    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  100 
 
 
2570 aa  5299    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  32.02 
 
 
1669 aa  733    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  32.5 
 
 
1669 aa  740    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  32.62 
 
 
2098 aa  739    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  29.67 
 
 
2077 aa  725    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  32.62 
 
 
1706 aa  750    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  32.52 
 
 
1726 aa  737    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  30.9 
 
 
1649 aa  635  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  29.04 
 
 
1932 aa  603  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  29.31 
 
 
1934 aa  598  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  28.79 
 
 
1693 aa  598  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  27.48 
 
 
1697 aa  582  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  28.04 
 
 
1748 aa  572  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 
1697 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  27.57 
 
 
1701 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  28.52 
 
 
1703 aa  559  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
1516 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  28.29 
 
 
1417 aa  520  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  33.27 
 
 
1925 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  26.87 
 
 
2117 aa  499  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 
1674 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  30.68 
 
 
1722 aa  457  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  32.27 
 
 
2274 aa  453  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  28.25 
 
 
1702 aa  447  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  29.2 
 
 
1700 aa  436  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  32.99 
 
 
2005 aa  433  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  29.22 
 
 
1594 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  31.47 
 
 
976 aa  384  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  26.22 
 
 
1956 aa  343  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  26.38 
 
 
1211 aa  338  9e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  31.3 
 
 
763 aa  226  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  30.2 
 
 
761 aa  217  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  32.13 
 
 
766 aa  179  9e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  34.77 
 
 
470 aa  145  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  30.68 
 
 
526 aa  140  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  37.11 
 
 
284 aa  103  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
577 aa  103  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  22.41 
 
 
1379 aa  102  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  25 
 
 
678 aa  84.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  28.29 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  22.57 
 
 
1328 aa  76.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  27.09 
 
 
341 aa  76.3  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  26.88 
 
 
339 aa  72.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  30.57 
 
 
900 aa  62.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  20.96 
 
 
988 aa  56.2  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  21.05 
 
 
894 aa  53.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  25 
 
 
1116 aa  53.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  27.78 
 
 
946 aa  53.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  27.69 
 
 
468 aa  53.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  26.95 
 
 
712 aa  52.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  20.04 
 
 
918 aa  52.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  19.67 
 
 
914 aa  51.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  26.07 
 
 
254 aa  51.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  25.95 
 
 
1037 aa  50.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.09 
 
 
1168 aa  50.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  38.57 
 
 
1065 aa  49.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  38.57 
 
 
1065 aa  49.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  22.16 
 
 
933 aa  48.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1912  N-6 DNA methylase  33.07 
 
 
691 aa  48.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  33.33 
 
 
957 aa  49.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  24.55 
 
 
1046 aa  48.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  26.72 
 
 
919 aa  48.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  26.86 
 
 
643 aa  47.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  26.11 
 
 
1081 aa  47.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  27.22 
 
 
1185 aa  47.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
450 aa  47.8  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  24.44 
 
 
927 aa  47.8  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  26.17 
 
 
1080 aa  47  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  28.99 
 
 
889 aa  47.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  24.38 
 
 
489 aa  47  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  24.71 
 
 
1147 aa  46.6  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  24.55 
 
 
508 aa  46.6  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  22.69 
 
 
966 aa  46.6  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  26.17 
 
 
952 aa  46.2  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  28 
 
 
529 aa  46.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  20.82 
 
 
1163 aa  46.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  26.95 
 
 
1154 aa  46.2  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  25 
 
 
442 aa  46.2  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  27.78 
 
 
968 aa  46.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  30.72 
 
 
449 aa  46.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>