56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0847 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  65.55 
 
 		 763 aa  635    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1092    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  57.29 
 
 		 761 aa  552  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  33.33 
 
 		 1706 aa  173  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  33.66 
 
 		 2077 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  30.53 
 
 		 1669 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  35.07 
 
 		 1722 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  29.7 
 
 		 766 aa  159  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  34.82 
 
 		 1642 aa  156  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  29.09 
 
 		 1649 aa  156  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  33.06 
 
 		 1669 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  35.27 
 
 		 2274 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 1674 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  33.47 
 
 		 1726 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  35.97 
 
 		 1575 aa  147  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  34.36 
 
 		 1925 aa  146  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  39.78 
 
 		 2098 aa  145  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  30.68 
 
 		 2570 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  33.2 
 
 		 1693 aa  137  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  31.35 
 
 		 1516 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  33.58 
 
 		 1697 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  34.48 
 
 		 1606 aa  133  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  32.4 
 
 		 1703 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  26.06 
 
 		 1700 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  30.5 
 
 		 1934 aa  130  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  30.56 
 
 		 1932 aa  130  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  34.3 
 
 		 1702 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1748 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  26.54 
 
 		 1697 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  29.21 
 
 		 2117 aa  124  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  29.1 
 
 		 1701 aa  124  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  34.54 
 
 		 2005 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  36.6 
 
 		 1956 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 1594 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  26.75 
 
 		 976 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  34.86 
 
 		 1417 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.02 
 
 		 678 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.48 
 
 		 953 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  35.05 
 
 		 933 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  32.46 
 
 		 958 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  32.46 
 
 		 958 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  29.14 
 
 		 986 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  42.19 
 
 		 1065 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  27.34 
 
 		 1379 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.52 
 
 		 919 aa  47.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  31.58 
 
 		 949 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  38.46 
 
 		 894 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  40 
 
 		 1082 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  38.81 
 
 		 840 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  27.68 
 
 		 957 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 969 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  41.51 
 
 		 952 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  37.93 
 
 		 900 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.8 
 
 		 971 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  30.53 
 
 		 946 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  27.1 
 
 		 945 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>