More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1280 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  100 
 
 		 2274 aa  4667    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  38.22 
 
 		 2098 aa  639    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  28.99 
 
 		 1703 aa  670    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  37.77 
 
 		 2077 aa  749    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  28.72 
 
 		 1697 aa  630  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  28.79 
 
 		 1693 aa  629  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  27.8 
 
 		 1697 aa  616  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  33.77 
 
 		 1669 aa  609  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  33.18 
 
 		 1669 aa  606  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  32.62 
 
 		 1642 aa  593  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  29.04 
 
 		 1722 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  33.09 
 
 		 1726 aa  589  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  32.37 
 
 		 1706 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  30.93 
 
 		 1925 aa  568  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  33.27 
 
 		 1649 aa  555  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  29.89 
 
 		 1606 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  29.27 
 
 		 1575 aa  525  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  29.33 
 
 		 1702 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  29.71 
 
 		 1700 aa  497  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 1516 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  29.46 
 
 		 1701 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  28.56 
 
 		 1748 aa  482  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  31.73 
 
 		 1932 aa  475  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  33.62 
 
 		 2005 aa  473  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  30.77 
 
 		 1934 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  31.79 
 
 		 2117 aa  472  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  32.27 
 
 		 2570 aa  453  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 1594 aa  400  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  27.74 
 
 		 1956 aa  390  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  29.02 
 
 		 976 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  29.57 
 
 		 1417 aa  387  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  27 
 
 		 1211 aa  365  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 1674 aa  360  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  32.82 
 
 		 763 aa  267  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  32.45 
 
 		 761 aa  264  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  31.6 
 
 		 766 aa  231  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  35.27 
 
 		 526 aa  152  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  32.12 
 
 		 470 aa  152  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  33.5 
 
 		 284 aa  109  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 577 aa  107  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.93 
 
 		 678 aa  100  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  20.37 
 
 		 1379 aa  89.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  24.1 
 
 		 1125 aa  89  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  22.02 
 
 		 1328 aa  79.7  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  29.91 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  23.36 
 
 		 1181 aa  75.5  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  22.26 
 
 		 1087 aa  75.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  22.16 
 
 		 821 aa  72  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  22.15 
 
 		 1069 aa  71.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  22.12 
 
 		 1096 aa  69.3  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  22.16 
 
 		 1031 aa  68.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.11 
 
 		 1139 aa  68.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  23.63 
 
 		 1084 aa  68.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  22.49 
 
 		 914 aa  68.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  25 
 
 		 1084 aa  67.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  32.56 
 
 		 669 aa  67.4  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  22.93 
 
 		 918 aa  67  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  22.54 
 
 		 970 aa  67  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  23.8 
 
 		 1084 aa  67  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  23.71 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  21.6 
 
 		 860 aa  66.2  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  24.2 
 
 		 1431 aa  65.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  22.51 
 
 		 1069 aa  65.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  23.32 
 
 		 966 aa  64.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.03 
 
 		 1007 aa  64.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  21.53 
 
 		 495 aa  63.9  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  24.06 
 
 		 621 aa  64.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.82 
 
 		 1102 aa  63.2  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  21.6 
 
 		 1023 aa  63.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.34 
 
 		 1112 aa  62.8  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  25.21 
 
 		 341 aa  62  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  22.12 
 
 		 572 aa  62  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  25.64 
 
 		 341 aa  62  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  24.72 
 
 		 964 aa  61.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  26.92 
 
 		 488 aa  61.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  22.43 
 
 		 1086 aa  61.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  25.81 
 
 		 1065 aa  60.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  25.81 
 
 		 1065 aa  60.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1088 aa  60.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  23.99 
 
 		 468 aa  60.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  21.04 
 
 		 1032 aa  60.1  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1088 aa  60.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  22.92 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  22.36 
 
 		 1068 aa  59.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  23.88 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  22.94 
 
 		 1077 aa  58.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  33.68 
 
 		 900 aa  58.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  26.5 
 
 		 488 aa  57.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  22.99 
 
 		 1055 aa  58.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  22.39 
 
 		 1111 aa  57.4  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  20.94 
 
 		 560 aa  57.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  31.07 
 
 		 894 aa  57.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  37.6 
 
 		 554 aa  57.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  21.47 
 
 		 876 aa  57  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  23.77 
 
 		 1066 aa  57  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  20.81 
 
 		 1067 aa  56.6  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.02 
 
 		 950 aa  56.6  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3080  helicase related protein  26.48 
 
 		 1786 aa  57  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  29.61 
 
 		 595 aa  56.2  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  24.29 
 
 		 1064 aa  56.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>