35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0796 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  677    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  34.1 
 
 
341 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  34.43 
 
 
341 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  32.1 
 
 
1606 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  34.06 
 
 
1575 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  32.1 
 
 
1703 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  30.8 
 
 
1697 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  31.82 
 
 
1697 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  28.83 
 
 
1956 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
1516 aa  89.4  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  29.7 
 
 
1700 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  29.81 
 
 
1702 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  29.74 
 
 
1693 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  31.13 
 
 
470 aa  86.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  30.83 
 
 
1417 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  28.9 
 
 
1701 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  29.62 
 
 
1748 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  27.17 
 
 
1925 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  26.99 
 
 
1669 aa  80.1  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  31.75 
 
 
2005 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  25 
 
 
1726 aa  77  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  26.32 
 
 
1669 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  26.88 
 
 
2570 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  25.19 
 
 
1642 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  25.91 
 
 
1722 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  31.22 
 
 
577 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  25.75 
 
 
1649 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  24.65 
 
 
1706 aa  67  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  25.85 
 
 
2077 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  23.71 
 
 
2274 aa  66.2  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  24.75 
 
 
1674 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  29.65 
 
 
1594 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  22.9 
 
 
2098 aa  57.4  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  25.58 
 
 
1932 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  25.58 
 
 
1934 aa  52  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>