279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1912 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  60.26 
 
 		 673 aa  688    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1912  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 691 aa  1320    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  44.22 
 
 		 636 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  45.18 
 
 		 675 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  37.34 
 
 		 677 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  39.97 
 
 		 625 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  39.51 
 
 		 680 aa  356  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  40.28 
 
 		 709 aa  350  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  39.77 
 
 		 698 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2674  N-6 DNA methylase  37.5 
 
 		 746 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559823  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  35.67 
 
 		 626 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1349  putative type I restriction system adenine methylase  36.44 
 
 		 558 aa  170  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  28.78 
 
 		 569 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  26.05 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  25.96 
 
 		 501 aa  119  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.54 
 
 		 538 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  27.67 
 
 		 540 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  26.15 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  30.49 
 
 		 849 aa  114  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  27.87 
 
 		 570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  28.4 
 
 		 511 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  28.4 
 
 		 540 aa  110  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  29.78 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  27.11 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  25.22 
 
 		 540 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  26.51 
 
 		 543 aa  108  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  25.38 
 
 		 521 aa  107  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  32.64 
 
 		 528 aa  107  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.99 
 
 		 549 aa  107  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  26.23 
 
 		 535 aa  107  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  28.61 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  25.57 
 
 		 567 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.33 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  25.07 
 
 		 519 aa  105  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.45 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  32.7 
 
 		 564 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  28 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  23.08 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  28.98 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  26.69 
 
 		 544 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  26.87 
 
 		 519 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  30.36 
 
 		 540 aa  102  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  27.56 
 
 		 576 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  26.59 
 
 		 517 aa  101  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  26.11 
 
 		 514 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  29.08 
 
 		 518 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.15 
 
 		 503 aa  99  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  26.15 
 
 		 525 aa  99  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  26.15 
 
 		 525 aa  99  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  25.94 
 
 		 515 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  20.29 
 
 		 510 aa  98.2  5e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  26.27 
 
 		 517 aa  97.8  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.5 
 
 		 544 aa  97.8  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  25.85 
 
 		 520 aa  97.4  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  26.12 
 
 		 527 aa  97.4  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  26.33 
 
 		 532 aa  97.1  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  28.93 
 
 		 537 aa  97.4  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  36 
 
 		 775 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  25.16 
 
 		 529 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.76 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  25.16 
 
 		 529 aa  96.3  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  30.8 
 
 		 499 aa  94.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  30.65 
 
 		 498 aa  93.2  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  22.86 
 
 		 567 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  26.95 
 
 		 518 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  33.08 
 
 		 633 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  26.82 
 
 		 539 aa  90.9  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.4 
 
 		 501 aa  87.8  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  29.72 
 
 		 799 aa  87.4  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  23.64 
 
 		 863 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  29.39 
 
 		 809 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  26.32 
 
 		 799 aa  86.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  25.58 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  28 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  23.83 
 
 		 874 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  29.28 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  27.56 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 810 aa  85.5  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  26.09 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  22.58 
 
 		 862 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  23.65 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  23.38 
 
 		 910 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  27.36 
 
 		 856 aa  84  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  29.08 
 
 		 508 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  32.1 
 
 		 827 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  29.08 
 
 		 523 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  30.68 
 
 		 504 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  25.25 
 
 		 863 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  27.36 
 
 		 810 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  28.07 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  28.37 
 
 		 871 aa  82  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  27.35 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  24.64 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.82 
 
 		 587 aa  80.9  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  28.7 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  24.92 
 
 		 863 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.79 
 
 		 855 aa  80.5  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.4 
 
 		 517 aa  80.1  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  28.77 
 
 		 500 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>