247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1580 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  100 
 
 		 636 aa  1244    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  56.08 
 
 		 675 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  47.94 
 
 		 673 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2674  N-6 DNA methylase  43.38 
 
 		 746 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559823  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  44.36 
 
 		 625 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1912  N-6 DNA methylase  43.78 
 
 		 691 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  40.22 
 
 		 626 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  37.85 
 
 		 677 aa  363  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  38.63 
 
 		 698 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  38.93 
 
 		 680 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  37.52 
 
 		 709 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1349  putative type I restriction system adenine methylase  37.08 
 
 		 558 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  28.93 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.25 
 
 		 538 aa  107  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  28.1 
 
 		 501 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.6 
 
 		 497 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  31.28 
 
 		 532 aa  100  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  29.82 
 
 		 568 aa  99.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  28.63 
 
 		 540 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  26.24 
 
 		 499 aa  99  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  25.89 
 
 		 498 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  27.65 
 
 		 500 aa  98.2  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  27.19 
 
 		 515 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  28.63 
 
 		 527 aa  97.1  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  28.46 
 
 		 499 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  27.89 
 
 		 528 aa  95.1  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.42 
 
 		 503 aa  94.7  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  26.92 
 
 		 511 aa  94.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  32.18 
 
 		 537 aa  93.6  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  28.57 
 
 		 569 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  28.77 
 
 		 543 aa  93.6  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  25.69 
 
 		 514 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  27.53 
 
 		 519 aa  92  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  29.35 
 
 		 523 aa  92  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  28.28 
 
 		 849 aa  91.3  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  30.88 
 
 		 521 aa  90.9  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  29.92 
 
 		 504 aa  90.9  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  29.85 
 
 		 540 aa  90.9  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  20.38 
 
 		 510 aa  90.9  7e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  30.29 
 
 		 535 aa  90.5  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.4 
 
 		 548 aa  90.5  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  24.33 
 
 		 809 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  25.38 
 
 		 505 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  31.19 
 
 		 498 aa  89.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 		 576 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  30.29 
 
 		 519 aa  88.6  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  28.31 
 
 		 510 aa  87.8  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  28.9 
 
 		 570 aa  87.4  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  25.21 
 
 		 501 aa  87  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  30.24 
 
 		 527 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  27.14 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  27.14 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  23.94 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  30.73 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  28.3 
 
 		 564 aa  84.7  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  29.35 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  25.75 
 
 		 574 aa  84.7  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  24.42 
 
 		 853 aa  84  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  23.57 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  23.51 
 
 		 862 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  28.23 
 
 		 544 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  25.82 
 
 		 810 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  26.23 
 
 		 808 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  23.45 
 
 		 871 aa  82.8  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.23 
 
 		 633 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.31 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  24.66 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  30.73 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.67 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  26.42 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  23.88 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  26.42 
 
 		 585 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  23.88 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  29.19 
 
 		 518 aa  81.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  30.36 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  29.08 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  30.28 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  25.2 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.58 
 
 		 587 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  27.4 
 
 		 496 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  24.32 
 
 		 874 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  25.09 
 
 		 567 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  23.83 
 
 		 863 aa  80.5  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  24.12 
 
 		 863 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  26.64 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.09 
 
 		 855 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  23.44 
 
 		 910 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  24.07 
 
 		 574 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  29.05 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  24.43 
 
 		 508 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  29.79 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  26.14 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  27.96 
 
 		 847 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  25.7 
 
 		 567 aa  77  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  23.61 
 
 		 799 aa  76.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  26.02 
 
 		 508 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.29 
 
 		 508 aa  77  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0369  N-6 DNA methylase  36.97 
 
 		 764 aa  77  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>