More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2731 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 626 aa  1204    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  40.22 
 
 		 636 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  39.79 
 
 		 673 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  36.9 
 
 		 675 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2674  N-6 DNA methylase  37.27 
 
 		 746 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559823  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  36.48 
 
 		 677 aa  293  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  40.27 
 
 		 625 aa  277  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  36.65 
 
 		 698 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  37.12 
 
 		 709 aa  262  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1912  N-6 DNA methylase  35.67 
 
 		 691 aa  253  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  33.48 
 
 		 680 aa  243  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1349  putative type I restriction system adenine methylase  40.06 
 
 		 558 aa  213  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  29.89 
 
 		 499 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  26.86 
 
 		 517 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  31.25 
 
 		 499 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25.08 
 
 		 809 aa  100  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  26.57 
 
 		 810 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.99 
 
 		 497 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  27.12 
 
 		 827 aa  97.8  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  29.44 
 
 		 799 aa  97.8  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  31.08 
 
 		 504 aa  97.4  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  26.77 
 
 		 808 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  31.93 
 
 		 532 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  26.09 
 
 		 498 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 496 aa  94.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  28.79 
 
 		 810 aa  94  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  30.67 
 
 		 501 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 799 aa  93.6  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 871 aa  92.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  26.39 
 
 		 847 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  28.43 
 
 		 501 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  24.7 
 
 		 814 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  31.56 
 
 		 505 aa  92  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  31.31 
 
 		 498 aa  91.7  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  26.34 
 
 		 501 aa  91.3  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  28.71 
 
 		 528 aa  91.3  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  25.91 
 
 		 494 aa  90.9  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  23.43 
 
 		 629 aa  90.9  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  24.71 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.82 
 
 		 538 aa  89.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  26.05 
 
 		 568 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  31.78 
 
 		 500 aa  89.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  25.16 
 
 		 535 aa  88.6  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  31.78 
 
 		 498 aa  89  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30.11 
 
 		 503 aa  88.2  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 		 511 aa  87.8  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  31.96 
 
 		 548 aa  87.4  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  32.2 
 
 		 503 aa  87.4  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  31.71 
 
 		 508 aa  87  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.08 
 
 		 549 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  26.67 
 
 		 495 aa  87  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  28.37 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  24.34 
 
 		 569 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  26.16 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  27.49 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  25.23 
 
 		 519 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  26.79 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  27.49 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  22.59 
 
 		 814 aa  84.7  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  25.45 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  30.24 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  24.39 
 
 		 585 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  24.35 
 
 		 574 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  27.47 
 
 		 508 aa  82.8  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  27.47 
 
 		 523 aa  83.2  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  29.17 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  27.1 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  22.97 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  29.95 
 
 		 633 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.44 
 
 		 587 aa  82  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.76 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  23.28 
 
 		 849 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  27.92 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  22.22 
 
 		 529 aa  80.5  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  29.09 
 
 		 519 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  30 
 
 		 535 aa  80.1  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  28.24 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  23.14 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  29.59 
 
 		 543 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.98 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  23.31 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.16 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  29.72 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  29.63 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  27.88 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  22.09 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  32.12 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  29.72 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  24.57 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2510  N-6 DNA methylase  31.52 
 
 		 689 aa  77.8  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.746903  normal  0.917843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  28.31 
 
 		 576 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.92 
 
 		 708 aa  77.4  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  24.79 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  23.71 
 
 		 570 aa  77.4  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  26.2 
 
 		 544 aa  76.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  19.28 
 
 		 510 aa  76.6  0.000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 592 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  27.96 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>