More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0161 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 		 506 aa  1048    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  69.28 
 
 		 499 aa  722    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  77.35 
 
 		 526 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  56.4 
 
 		 495 aa  555  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  53.32 
 
 		 526 aa  544  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  56.48 
 
 		 501 aa  544  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  53.15 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  53.11 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  51.41 
 
 		 527 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1127  N-6 DNA methylase  78.77 
 
 		 302 aa  486  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  46.29 
 
 		 527 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  43.96 
 
 		 633 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  43.05 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  40.43 
 
 		 523 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  40.43 
 
 		 508 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  40.88 
 
 		 504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  40.89 
 
 		 505 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  41.46 
 
 		 587 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  41.77 
 
 		 574 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  40.26 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  40.95 
 
 		 574 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  40.12 
 
 		 574 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  42.76 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  39.75 
 
 		 809 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  39.46 
 
 		 810 aa  333  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  38.72 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  38.72 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  38.53 
 
 		 518 aa  329  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  38.53 
 
 		 518 aa  329  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  40.75 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  37.96 
 
 		 495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  37.84 
 
 		 847 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  40.38 
 
 		 498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  39.5 
 
 		 808 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  40.51 
 
 		 799 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  39.66 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  42.15 
 
 		 585 aa  326  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  37.24 
 
 		 537 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  38.31 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  40.3 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  38.96 
 
 		 814 aa  319  7.999999999999999e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  36.73 
 
 		 535 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  37.36 
 
 		 544 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  37.13 
 
 		 537 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  37.13 
 
 		 537 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  39.83 
 
 		 827 aa  316  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  37.31 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  36.38 
 
 		 535 aa  315  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  37.11 
 
 		 540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  37.97 
 
 		 525 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  36.65 
 
 		 537 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  37.38 
 
 		 534 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.76 
 
 		 534 aa  311  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  36.94 
 
 		 547 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  39.41 
 
 		 499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  37.64 
 
 		 504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  37.79 
 
 		 810 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  40 
 
 		 908 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  41.46 
 
 		 873 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  39.35 
 
 		 814 aa  307  4.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  42.71 
 
 		 554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  38.59 
 
 		 814 aa  304  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  37.9 
 
 		 871 aa  303  4.0000000000000003e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  39.57 
 
 		 824 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  36.95 
 
 		 799 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  34.43 
 
 		 568 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  36.53 
 
 		 523 aa  293  3e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  37.28 
 
 		 815 aa  293  7e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.88 
 
 		 708 aa  292  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  37.76 
 
 		 808 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  34.5 
 
 		 547 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  35.04 
 
 		 508 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  35.7 
 
 		 527 aa  286  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.33 
 
 		 462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  38.66 
 
 		 513 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  34.65 
 
 		 503 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  38.63 
 
 		 862 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  36.06 
 
 		 505 aa  280  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  37.32 
 
 		 891 aa  280  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  37.35 
 
 		 910 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  34.91 
 
 		 492 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  35.24 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  37.23 
 
 		 863 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  34.67 
 
 		 516 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  36.56 
 
 		 863 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.05 
 
 		 508 aa  273  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  35.47 
 
 		 863 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  35.66 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  33.21 
 
 		 511 aa  270  5e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  36.11 
 
 		 853 aa  270  5.9999999999999995e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  36.47 
 
 		 874 aa  269  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  35.26 
 
 		 822 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  32.76 
 
 		 522 aa  269  8e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  32.19 
 
 		 547 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  38.83 
 
 		 584 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  33.27 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  35.61 
 
 		 523 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  34.47 
 
 		 816 aa  265  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  33.14 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  33.14 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>