More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0427 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  50.42 
 
 
799 aa  733    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  43.17 
 
 
871 aa  668    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  69.73 
 
 
808 aa  1139    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 
827 aa  1696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  57.32 
 
 
814 aa  901    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  59.95 
 
 
799 aa  937    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  52.96 
 
 
809 aa  855    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  50 
 
 
810 aa  791    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  51.45 
 
 
847 aa  837    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  55.62 
 
 
814 aa  876    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  50.18 
 
 
810 aa  768    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  41.44 
 
 
495 aa  359  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  42.16 
 
 
501 aa  352  1e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.29 
 
 
855 aa  343  8e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  38.36 
 
 
494 aa  334  5e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  29.52 
 
 
856 aa  331  4e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  29.45 
 
 
863 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  29.02 
 
 
863 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  38.88 
 
 
505 aa  326  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  30.18 
 
 
853 aa  324  3e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  29.98 
 
 
863 aa  325  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  28.75 
 
 
910 aa  324  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  30.07 
 
 
874 aa  320  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  28.59 
 
 
862 aa  320  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.57 
 
 
587 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  39.83 
 
 
506 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  38.57 
 
 
574 aa  315  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  37.8 
 
 
574 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  28.27 
 
 
815 aa  311  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  38.58 
 
 
574 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  38.43 
 
 
527 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  33.59 
 
 
908 aa  308  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  39.01 
 
 
526 aa  306  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  34.12 
 
 
873 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  35.97 
 
 
505 aa  304  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  32.14 
 
 
824 aa  302  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  28.12 
 
 
814 aa  302  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  38.54 
 
 
499 aa  298  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  36.34 
 
 
633 aa  296  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  38.05 
 
 
495 aa  295  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  29.35 
 
 
891 aa  295  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  35.56 
 
 
527 aa  290  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  37.85 
 
 
518 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  35.17 
 
 
523 aa  288  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  35.17 
 
 
508 aa  287  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  35.53 
 
 
526 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  36.38 
 
 
585 aa  281  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  36.61 
 
 
518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  36.61 
 
 
518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  36.61 
 
 
518 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  36.61 
 
 
518 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  36.67 
 
 
528 aa  273  9e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  30.6 
 
 
822 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  31.03 
 
 
808 aa  273  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  35.61 
 
 
525 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  36.12 
 
 
525 aa  267  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  35.21 
 
 
499 aa  265  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  35.28 
 
 
499 aa  264  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  37.01 
 
 
535 aa  263  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  35.21 
 
 
537 aa  261  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  35.21 
 
 
537 aa  261  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  31.71 
 
 
816 aa  261  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.32 
 
 
462 aa  257  5e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  34.4 
 
 
544 aa  256  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  45.24 
 
 
554 aa  256  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  37.48 
 
 
534 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  35.15 
 
 
505 aa  251  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  34.36 
 
 
537 aa  249  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  33.98 
 
 
568 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  34.43 
 
 
505 aa  248  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  35.42 
 
 
504 aa  248  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  35.18 
 
 
537 aa  248  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  34.53 
 
 
547 aa  247  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  34.85 
 
 
535 aa  246  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  32.09 
 
 
523 aa  245  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  34.38 
 
 
496 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  33.8 
 
 
520 aa  243  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  34.24 
 
 
498 aa  243  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  34.39 
 
 
496 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  35.4 
 
 
534 aa  240  9e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.27 
 
 
860 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  39.34 
 
 
540 aa  235  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  34.58 
 
 
547 aa  234  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  34.51 
 
 
500 aa  233  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  33.47 
 
 
523 aa  233  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  33.54 
 
 
498 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  33.27 
 
 
522 aa  231  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  32.33 
 
 
508 aa  231  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  39.51 
 
 
584 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  32.24 
 
 
493 aa  229  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  30.98 
 
 
492 aa  229  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  32.87 
 
 
515 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  35.87 
 
 
521 aa  228  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  31.34 
 
 
503 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  32.55 
 
 
526 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  32.73 
 
 
524 aa  226  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  33.94 
 
 
523 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.33 
 
 
508 aa  225  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  33.53 
 
 
523 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  34.29 
 
 
517 aa  223  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>