More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0405 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  45.5 
 
 		 871 aa  717    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  52.4 
 
 		 814 aa  810    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  48.35 
 
 		 810 aa  753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  51.34 
 
 		 814 aa  816    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  46.52 
 
 		 810 aa  732    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 		 799 aa  1609    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  47.66 
 
 		 847 aa  794    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  51.6 
 
 		 808 aa  797    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  53.9 
 
 		 799 aa  822    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  50.37 
 
 		 809 aa  799    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  50.42 
 
 		 827 aa  793    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  44.75 
 
 		 495 aa  382  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  32.87 
 
 		 856 aa  377  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30.92 
 
 		 855 aa  379  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  33.85 
 
 		 815 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  31.13 
 
 		 863 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  43.75 
 
 		 501 aa  365  2e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  30.71 
 
 		 910 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  31.32 
 
 		 863 aa  360  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  32.22 
 
 		 862 aa  360  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  42.51 
 
 		 494 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  31.11 
 
 		 874 aa  357  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  31.36 
 
 		 863 aa  351  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  30.98 
 
 		 853 aa  345  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  42.18 
 
 		 499 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  39.33 
 
 		 505 aa  340  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  40.2 
 
 		 527 aa  340  9e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  40.04 
 
 		 505 aa  337  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  39.12 
 
 		 526 aa  337  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  35.22 
 
 		 814 aa  335  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  39.12 
 
 		 633 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  36.03 
 
 		 574 aa  333  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  34.1 
 
 		 891 aa  330  5.0000000000000004e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  40.51 
 
 		 506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  39.7 
 
 		 495 aa  327  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  35.35 
 
 		 587 aa  324  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  30.47 
 
 		 908 aa  319  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  36.96 
 
 		 523 aa  319  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  36.96 
 
 		 508 aa  319  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  34.85 
 
 		 574 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  37.15 
 
 		 574 aa  316  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  28.07 
 
 		 824 aa  313  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  29.18 
 
 		 816 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  35.98 
 
 		 526 aa  308  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  31.93 
 
 		 808 aa  307  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  38.09 
 
 		 585 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  31.12 
 
 		 873 aa  301  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  37.83 
 
 		 528 aa  293  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  35.14 
 
 		 527 aa  291  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  36.58 
 
 		 504 aa  286  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  38.32 
 
 		 505 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.51 
 
 		 822 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  38.43 
 
 		 518 aa  284  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  36.71 
 
 		 498 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  37.04 
 
 		 518 aa  280  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  37.04 
 
 		 518 aa  280  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  36.83 
 
 		 518 aa  278  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  36.83 
 
 		 518 aa  278  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  36.08 
 
 		 500 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  36.57 
 
 		 525 aa  270  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.49 
 
 		 462 aa  270  8.999999999999999e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  34.6 
 
 		 523 aa  269  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  36.08 
 
 		 498 aa  270  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  35.73 
 
 		 496 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  37.13 
 
 		 499 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  37.26 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  36.46 
 
 		 522 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  34.13 
 
 		 527 aa  261  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  37.05 
 
 		 525 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  47.04 
 
 		 554 aa  260  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  36.23 
 
 		 522 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  34.54 
 
 		 860 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  34.24 
 
 		 505 aa  257  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  33.66 
 
 		 568 aa  257  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  34.87 
 
 		 511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  36.75 
 
 		 534 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  35.24 
 
 		 535 aa  256  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  35.21 
 
 		 520 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  34.15 
 
 		 516 aa  255  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  33.8 
 
 		 523 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.21 
 
 		 534 aa  254  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  34.95 
 
 		 520 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  34.95 
 
 		 520 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  35.28 
 
 		 537 aa  253  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  35.28 
 
 		 537 aa  253  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  34.52 
 
 		 513 aa  252  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  33.79 
 
 		 522 aa  252  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  35.2 
 
 		 544 aa  252  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  35.55 
 
 		 537 aa  250  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 496 aa  248  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 508 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 547 aa  243  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  32.82 
 
 		 523 aa  243  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  35.13 
 
 		 547 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  33.46 
 
 		 517 aa  241  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  33.14 
 
 		 547 aa  240  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  33.48 
 
 		 492 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  33.81 
 
 		 516 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  34.17 
 
 		 537 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  34.45 
 
 		 547 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>