More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0606 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  100 
 
 
523 aa  1067    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  44.44 
 
 
633 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  44.6 
 
 
574 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  44.66 
 
 
495 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  44.6 
 
 
574 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  44.25 
 
 
587 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  44 
 
 
574 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  43.45 
 
 
523 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  45.92 
 
 
505 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  43.45 
 
 
508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  44.14 
 
 
585 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  42.09 
 
 
815 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  39.23 
 
 
568 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  42.05 
 
 
495 aa  368  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  41.5 
 
 
814 aa  363  3e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  41.14 
 
 
501 aa  360  5e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  39.13 
 
 
816 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  38.97 
 
 
822 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  38.91 
 
 
494 aa  339  8e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  39.88 
 
 
891 aa  335  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  38.29 
 
 
808 aa  332  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  36.08 
 
 
493 aa  329  7e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  37.25 
 
 
860 aa  326  8.000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  38.77 
 
 
526 aa  324  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  36.21 
 
 
504 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  36.69 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  38.19 
 
 
873 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  36.59 
 
 
527 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  34.82 
 
 
498 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  36.22 
 
 
908 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  36.59 
 
 
824 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36 
 
 
708 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  36.51 
 
 
504 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  34.86 
 
 
499 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  34.16 
 
 
498 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.04 
 
 
508 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  34.62 
 
 
500 aa  298  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  34.82 
 
 
505 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  34.62 
 
 
496 aa  297  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  36.53 
 
 
506 aa  296  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  35.5 
 
 
492 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  34.36 
 
 
499 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  34.49 
 
 
505 aa  293  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  35.91 
 
 
503 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  33.76 
 
 
526 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  36.26 
 
 
499 aa  290  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  34.58 
 
 
508 aa  286  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  32.76 
 
 
496 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  34.44 
 
 
527 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  32.46 
 
 
522 aa  274  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  35.34 
 
 
528 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  34.99 
 
 
799 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  33.93 
 
 
809 aa  270  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  33.64 
 
 
540 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  34.41 
 
 
810 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  34.68 
 
 
518 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  34.18 
 
 
808 aa  260  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  34.68 
 
 
518 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  34.68 
 
 
518 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  34.68 
 
 
518 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  33.46 
 
 
511 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  34.69 
 
 
810 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  33.39 
 
 
518 aa  257  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  33.46 
 
 
523 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  36.84 
 
 
554 aa  256  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  32.15 
 
 
527 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  32.93 
 
 
516 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  33.97 
 
 
680 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  33.02 
 
 
510 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  32.68 
 
 
827 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  33.13 
 
 
522 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.56 
 
 
462 aa  249  7e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  31.83 
 
 
547 aa  249  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  32.58 
 
 
513 aa  249  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 
814 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  32.93 
 
 
522 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  32.53 
 
 
814 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  31.44 
 
 
847 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  32.84 
 
 
525 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  30.47 
 
 
516 aa  240  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.15 
 
 
497 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  32.96 
 
 
498 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  30.87 
 
 
547 aa  239  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  32.61 
 
 
525 aa  239  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  31.39 
 
 
799 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  30.96 
 
 
520 aa  236  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  30.96 
 
 
520 aa  236  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  31.93 
 
 
529 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  31.54 
 
 
871 aa  234  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  31.69 
 
 
529 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  31.25 
 
 
537 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  32.22 
 
 
514 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  31.25 
 
 
537 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  32.7 
 
 
500 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  31.07 
 
 
544 aa  232  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  31.9 
 
 
519 aa  232  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  30.91 
 
 
511 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  31.67 
 
 
527 aa  229  7e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  30.28 
 
 
540 aa  229  9e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  30.93 
 
 
534 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>