More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04440 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 		 495 aa  1020    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  55.76 
 
 		 633 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  54.27 
 
 		 523 aa  542  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  54.27 
 
 		 508 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  53.23 
 
 		 574 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  52.95 
 
 		 574 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  52 
 
 		 587 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  52.11 
 
 		 574 aa  511  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  51.5 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  53.42 
 
 		 585 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  47.44 
 
 		 568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  49.58 
 
 		 815 aa  470  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  48.96 
 
 		 814 aa  466  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  48.95 
 
 		 808 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  45.53 
 
 		 822 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  44.38 
 
 		 498 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  43.66 
 
 		 499 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  43.89 
 
 		 523 aa  428  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  45.02 
 
 		 860 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  47.17 
 
 		 908 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  44.63 
 
 		 499 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  45.62 
 
 		 816 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  46.25 
 
 		 824 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  44 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  41.97 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  42.8 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  43.2 
 
 		 495 aa  411  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  43.23 
 
 		 496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  42.25 
 
 		 500 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  41.8 
 
 		 498 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  47.54 
 
 		 873 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  44.47 
 
 		 891 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  41.86 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  39.89 
 
 		 522 aa  392  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  41.6 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  41.32 
 
 		 508 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  40.7 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  40.85 
 
 		 492 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  40.28 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  39.92 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  40.66 
 
 		 513 aa  372  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  40.66 
 
 		 503 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  38.65 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  40.57 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  38.21 
 
 		 527 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  39.72 
 
 		 527 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.63 
 
 		 708 aa  361  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  40.76 
 
 		 493 aa  361  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.56 
 
 		 508 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  39.71 
 
 		 516 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  40.04 
 
 		 526 aa  356  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  40.21 
 
 		 522 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  40 
 
 		 522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  38.36 
 
 		 520 aa  352  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  38.36 
 
 		 520 aa  352  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  36.18 
 
 		 547 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  38.14 
 
 		 505 aa  348  9e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  36.36 
 
 		 547 aa  344  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  39.13 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  37.96 
 
 		 506 aa  336  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  36.84 
 
 		 527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  39.7 
 
 		 799 aa  327  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  38.54 
 
 		 810 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  35.23 
 
 		 526 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  37.8 
 
 		 501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  36.08 
 
 		 809 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  37.8 
 
 		 501 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  38.22 
 
 		 808 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  36.75 
 
 		 810 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  34.61 
 
 		 847 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  37.48 
 
 		 518 aa  302  8.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  37.69 
 
 		 518 aa  302  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.91 
 
 		 538 aa  302  9e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  37.69 
 
 		 518 aa  302  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  37.5 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  37.5 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  34.67 
 
 		 610 aa  300  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  35.84 
 
 		 511 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  35.88 
 
 		 498 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  36.03 
 
 		 814 aa  299  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 519 aa  297  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  38.05 
 
 		 827 aa  296  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.78 
 
 		 503 aa  295  9e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  35.58 
 
 		 528 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.49 
 
 		 497 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  34.11 
 
 		 510 aa  293  4e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  34.95 
 
 		 540 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  35.33 
 
 		 517 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1565  N-6 DNA methylase  34.75 
 
 		 519 aa  291  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236926  unclonable  0.0000184799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  35.66 
 
 		 544 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  36.27 
 
 		 799 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  36.19 
 
 		 814 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  36.14 
 
 		 518 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  35.5 
 
 		 544 aa  286  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  34.87 
 
 		 523 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  34.9 
 
 		 515 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  36.21 
 
 		 527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  35.83 
 
 		 519 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  33.86 
 
 		 519 aa  282  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  37.21 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>