More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2210 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 522 aa  1076    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  67.7 
 
 		 520 aa  726    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  80.16 
 
 		 516 aa  843    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  63.9 
 
 		 547 aa  716    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  64.7 
 
 		 547 aa  720    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  98.66 
 
 		 522 aa  1061    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  67.7 
 
 		 520 aa  726    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  52.74 
 
 		 511 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  50.77 
 
 		 527 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  51.74 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  50.86 
 
 		 523 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  49.04 
 
 		 522 aa  514  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  51.89 
 
 		 513 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  46.01 
 
 		 610 aa  452  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 519 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1565  N-6 DNA methylase  45.86 
 
 		 519 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236926  unclonable  0.0000184799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  39.67 
 
 		 495 aa  360  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  37.92 
 
 		 574 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.4 
 
 		 587 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  37.2 
 
 		 574 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  37.3 
 
 		 574 aa  316  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  38.14 
 
 		 585 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  34.44 
 
 		 633 aa  303  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  36.95 
 
 		 523 aa  297  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  36.95 
 
 		 508 aa  296  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  37.19 
 
 		 815 aa  290  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  37.6 
 
 		 505 aa  289  9e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  35.27 
 
 		 814 aa  287  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  37.21 
 
 		 908 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  36.31 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  35.35 
 
 		 505 aa  276  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  36.73 
 
 		 824 aa  276  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  34.12 
 
 		 492 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  35.1 
 
 		 501 aa  273  7e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  35.24 
 
 		 508 aa  270  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  34.04 
 
 		 504 aa  270  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  34.23 
 
 		 808 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  34.17 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  35.05 
 
 		 496 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  32.55 
 
 		 499 aa  263  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  33.59 
 
 		 496 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  36.46 
 
 		 799 aa  262  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  34.53 
 
 		 504 aa  261  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  33.61 
 
 		 816 aa  260  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  33.98 
 
 		 506 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  34.57 
 
 		 822 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  33.47 
 
 		 526 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.32 
 
 		 708 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  32.79 
 
 		 499 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  33.47 
 
 		 493 aa  259  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  33.74 
 
 		 891 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.39 
 
 		 508 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  34.36 
 
 		 505 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  32.22 
 
 		 568 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  33.4 
 
 		 500 aa  256  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  33.83 
 
 		 503 aa  256  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  33.4 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.91 
 
 		 860 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  32.65 
 
 		 527 aa  253  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  32.49 
 
 		 526 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  34.19 
 
 		 873 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  32.75 
 
 		 523 aa  249  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  32.87 
 
 		 505 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  30.53 
 
 		 494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  30.63 
 
 		 527 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  35.33 
 
 		 810 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  34.24 
 
 		 499 aa  243  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  32.45 
 
 		 518 aa  236  9e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  34.63 
 
 		 808 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  34.43 
 
 		 810 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  34.16 
 
 		 799 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  33.82 
 
 		 809 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  33.46 
 
 		 847 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  33.06 
 
 		 871 aa  224  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  34.36 
 
 		 814 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  33.6 
 
 		 827 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  31.16 
 
 		 528 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  30.56 
 
 		 520 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  32.66 
 
 		 814 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  30.56 
 
 		 518 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  30.56 
 
 		 518 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  30.37 
 
 		 518 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  30.37 
 
 		 518 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  28.6 
 
 		 510 aa  210  4e-53  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30.59 
 
 		 544 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  30 
 
 		 521 aa  210  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  32.6 
 
 		 680 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  28.65 
 
 		 525 aa  206  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  28.65 
 
 		 525 aa  206  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.21 
 
 		 538 aa  206  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  28.63 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  29.71 
 
 		 501 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  28.78 
 
 		 532 aa  204  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.62 
 
 		 462 aa  203  6e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  29.53 
 
 		 539 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.85 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  29.25 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  31.76 
 
 		 498 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  29.55 
 
 		 529 aa  197  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  32.77 
 
 		 554 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>