More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1177 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1565  N-6 DNA methylase  87.48 
 
 
519 aa  927    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236926  unclonable  0.0000184799 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
519 aa  1062    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  89.08 
 
 
610 aa  918    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  53.4 
 
 
527 aa  512  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  50.84 
 
 
522 aa  512  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  51.55 
 
 
511 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  50.61 
 
 
516 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  49.63 
 
 
523 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  50.83 
 
 
513 aa  484  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  49.48 
 
 
516 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  49.19 
 
 
520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  49.19 
 
 
520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  45.11 
 
 
547 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  44.83 
 
 
547 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  48.03 
 
 
522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  47.83 
 
 
522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  35.45 
 
 
495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  36.75 
 
 
498 aa  279  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  37.38 
 
 
496 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  32.93 
 
 
574 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  36.14 
 
 
500 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  33.27 
 
 
815 aa  263  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  32.53 
 
 
574 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  37.16 
 
 
498 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.28 
 
 
587 aa  260  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  37.26 
 
 
505 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  32.8 
 
 
499 aa  257  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  33.97 
 
 
505 aa  256  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  37.68 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  32.6 
 
 
499 aa  252  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  35.46 
 
 
808 aa  252  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  31.99 
 
 
814 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  34.03 
 
 
496 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  32.1 
 
 
585 aa  249  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  34.17 
 
 
633 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  31.8 
 
 
574 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  31.57 
 
 
495 aa  243  6e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  33.47 
 
 
526 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  35.32 
 
 
505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  31.77 
 
 
508 aa  239  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  31.77 
 
 
523 aa  239  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  32.82 
 
 
891 aa  237  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  31.88 
 
 
501 aa  237  4e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  33.13 
 
 
822 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  34.8 
 
 
508 aa  233  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  31.69 
 
 
492 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  29.82 
 
 
527 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  31.94 
 
 
504 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  32.64 
 
 
506 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  32.59 
 
 
799 aa  228  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30.92 
 
 
708 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  34.29 
 
 
503 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.26 
 
 
508 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  29.32 
 
 
568 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  32.86 
 
 
816 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  29.52 
 
 
824 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.79 
 
 
860 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  30.43 
 
 
494 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  30.75 
 
 
908 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  33.68 
 
 
499 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  30.66 
 
 
873 aa  210  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  31.65 
 
 
527 aa  206  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  28.49 
 
 
523 aa  205  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  31.68 
 
 
814 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  31.21 
 
 
808 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.98 
 
 
497 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  32.11 
 
 
498 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  29.92 
 
 
680 aa  198  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  31.88 
 
 
810 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  28.65 
 
 
518 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  30.86 
 
 
871 aa  196  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  31.4 
 
 
799 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  31.03 
 
 
827 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.69 
 
 
544 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  27.85 
 
 
493 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  29.19 
 
 
847 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  31.2 
 
 
809 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  28.71 
 
 
505 aa  190  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  30.49 
 
 
810 aa  187  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  28.54 
 
 
526 aa  187  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  27.89 
 
 
510 aa  186  8e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  29.47 
 
 
540 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  27.92 
 
 
529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.66 
 
 
503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  27.67 
 
 
518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.86 
 
 
538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  27.67 
 
 
518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  27.49 
 
 
518 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  27.49 
 
 
518 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  29.07 
 
 
514 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  27.62 
 
 
520 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 
528 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  27.62 
 
 
489 aa  177  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  27.52 
 
 
529 aa  176  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  28.77 
 
 
543 aa  176  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  29.47 
 
 
535 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  30.2 
 
 
814 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  26.78 
 
 
522 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.35 
 
 
549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  28.6 
 
 
519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>