More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1896 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  65.23 
 
 		 516 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  64.18 
 
 		 527 aa  686    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  69.01 
 
 		 513 aa  716    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 511 aa  1048    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  64.5 
 
 		 522 aa  702    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  61.57 
 
 		 523 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  52.38 
 
 		 547 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  52.01 
 
 		 547 aa  567  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  52.99 
 
 		 520 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  52.99 
 
 		 520 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  54.53 
 
 		 516 aa  545  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  53.7 
 
 		 522 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  53.29 
 
 		 522 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  49.23 
 
 		 610 aa  498  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 519 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1565  N-6 DNA methylase  50.2 
 
 		 519 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236926  unclonable  0.0000184799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  41.6 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  36.84 
 
 		 499 aa  342  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  38.63 
 
 		 505 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  37.83 
 
 		 499 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  37.11 
 
 		 498 aa  334  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  37.16 
 
 		 504 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  37.75 
 
 		 496 aa  332  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  37.89 
 
 		 523 aa  329  7e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  37.89 
 
 		 508 aa  329  9e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  38.4 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  37.57 
 
 		 500 aa  324  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  38.05 
 
 		 574 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  36.91 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  37.25 
 
 		 505 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  38.57 
 
 		 814 aa  313  3.9999999999999997e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  34.76 
 
 		 568 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  37 
 
 		 574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  37 
 
 		 574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  37.37 
 
 		 815 aa  306  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  36.36 
 
 		 496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.03 
 
 		 587 aa  305  9.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  37.47 
 
 		 585 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  35.03 
 
 		 495 aa  294  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  34.44 
 
 		 492 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  34.71 
 
 		 504 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.13 
 
 		 708 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  34.17 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  37.01 
 
 		 860 aa  283  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  36.65 
 
 		 505 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  36.25 
 
 		 808 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  35.42 
 
 		 494 aa  279  7e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.05 
 
 		 508 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  33.21 
 
 		 506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  36.44 
 
 		 816 aa  274  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  35.85 
 
 		 824 aa  273  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  33 
 
 		 526 aa  273  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  34.76 
 
 		 908 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  35.62 
 
 		 508 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  34.62 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  33.93 
 
 		 493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  32.59 
 
 		 527 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  32.33 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  35.25 
 
 		 822 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  35.81 
 
 		 873 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  33.4 
 
 		 891 aa  259  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  33.08 
 
 		 505 aa  259  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.88 
 
 		 503 aa  256  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  33.2 
 
 		 499 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  34.79 
 
 		 799 aa  256  7e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  32.78 
 
 		 527 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.03 
 
 		 544 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.54 
 
 		 538 aa  250  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  30.84 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  33.33 
 
 		 540 aa  247  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  32.3 
 
 		 501 aa  246  8e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  30.94 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  32.4 
 
 		 518 aa  243  6e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  32.23 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  32.91 
 
 		 543 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.88 
 
 		 549 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  30.95 
 
 		 544 aa  239  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  32.99 
 
 		 814 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.53 
 
 		 497 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  32.06 
 
 		 847 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  31.57 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  34.32 
 
 		 498 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  31.64 
 
 		 521 aa  236  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  33.48 
 
 		 809 aa  236  9e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  33.2 
 
 		 814 aa  234  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  32.14 
 
 		 519 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  31.35 
 
 		 529 aa  234  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  30.15 
 
 		 526 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  33.4 
 
 		 511 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  32.78 
 
 		 541 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  31.73 
 
 		 540 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  29.9 
 
 		 567 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  32.79 
 
 		 799 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  32.2 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  32.76 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  30.89 
 
 		 523 aa  232  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  32.2 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  32.37 
 
 		 810 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  32.2 
 
 		 518 aa  231  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  30.67 
 
 		 568 aa  231  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>