More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0019 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  63.28 
 
 		 525 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  62.48 
 
 		 532 aa  666    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  97.6 
 
 		 501 aa  1007    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  61.51 
 
 		 511 aa  653    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  62.36 
 
 		 538 aa  680    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  63.28 
 
 		 525 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 501 aa  1027    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  59.22 
 
 		 520 aa  631  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  61.89 
 
 		 517 aa  629  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  61.1 
 
 		 518 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  61.31 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  59.4 
 
 		 503 aa  611  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  58.83 
 
 		 518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  58.35 
 
 		 510 aa  601  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  58.17 
 
 		 540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  59.72 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  56.23 
 
 		 527 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  57.65 
 
 		 514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  57.31 
 
 		 519 aa  578  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  57.54 
 
 		 515 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  57.68 
 
 		 521 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  55.84 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  55.09 
 
 		 537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  53.98 
 
 		 519 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  52.15 
 
 		 535 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  51.58 
 
 		 540 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  53.59 
 
 		 523 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  51.52 
 
 		 528 aa  548  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  53.28 
 
 		 517 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  55.11 
 
 		 527 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  53.65 
 
 		 540 aa  534  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  52.12 
 
 		 576 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  49.91 
 
 		 544 aa  534  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  49.1 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  50.44 
 
 		 570 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  51.84 
 
 		 529 aa  528  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  49.72 
 
 		 539 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  51.13 
 
 		 549 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  50 
 
 		 564 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  51.05 
 
 		 529 aa  526  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  48.12 
 
 		 567 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  48.83 
 
 		 569 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  48.67 
 
 		 544 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  51.06 
 
 		 544 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  50.29 
 
 		 541 aa  521  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  50 
 
 		 568 aa  520  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  47.54 
 
 		 540 aa  508  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  49.14 
 
 		 548 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  50.47 
 
 		 543 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  50.35 
 
 		 849 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  42.4 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  42.43 
 
 		 508 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  39.28 
 
 		 528 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.77 
 
 		 517 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  39.32 
 
 		 533 aa  349  8e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  37.91 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  37.99 
 
 		 538 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  40.99 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  40.99 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  37.8 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  34.54 
 
 		 526 aa  293  5e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  37.13 
 
 		 662 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  36.31 
 
 		 633 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  36.81 
 
 		 574 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  35.96 
 
 		 587 aa  276  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  35.9 
 
 		 574 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  35.91 
 
 		 505 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  34.77 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  34.77 
 
 		 508 aa  269  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  35.67 
 
 		 694 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  37.69 
 
 		 814 aa  264  4e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  32.83 
 
 		 522 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  36.26 
 
 		 574 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.9 
 
 		 860 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2469  N-6 DNA methylase  35.97 
 
 		 772 aa  259  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  35.54 
 
 		 585 aa  256  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  36.15 
 
 		 815 aa  246  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  34.22 
 
 		 565 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  32.21 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  31.85 
 
 		 816 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  34.04 
 
 		 495 aa  243  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  32.55 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 494 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  30.78 
 
 		 523 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  33.27 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  32.49 
 
 		 808 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  32.38 
 
 		 511 aa  239  5.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  32.29 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  33.05 
 
 		 822 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 709 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  32.35 
 
 		 504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  34.67 
 
 		 824 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  31.28 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  32.09 
 
 		 499 aa  231  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  32.82 
 
 		 873 aa  230  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  30.45 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  31.72 
 
 		 506 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  32.3 
 
 		 526 aa  227  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  32.36 
 
 		 499 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>