More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1779 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  51.5 
 
 		 871 aa  709    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  56.93 
 
 		 814 aa  880    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  51.1 
 
 		 810 aa  780    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  52.5 
 
 		 810 aa  831    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  100 
 
 		 799 aa  1643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  60.44 
 
 		 827 aa  973    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  64.56 
 
 		 808 aa  1053    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  54.39 
 
 		 809 aa  877    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  57.58 
 
 		 814 aa  896    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  54.03 
 
 		 799 aa  807    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  53.5 
 
 		 847 aa  876    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  41.74 
 
 		 495 aa  372  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  30.96 
 
 		 863 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  41.4 
 
 		 501 aa  357  5.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  30.55 
 
 		 910 aa  355  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  29.83 
 
 		 862 aa  354  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  29.87 
 
 		 863 aa  350  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  30.59 
 
 		 856 aa  347  4e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 908 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  30.57 
 
 		 863 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.43 
 
 		 855 aa  342  1e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  28.72 
 
 		 815 aa  341  4e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  29.83 
 
 		 874 aa  340  9e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  30.09 
 
 		 824 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  34.43 
 
 		 853 aa  337  7e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  37.9 
 
 		 494 aa  331  3e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  38.08 
 
 		 505 aa  325  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1604  type I restriction-modification system specificity subunit  64.92 
 
 		 251 aa  317  5e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  28.94 
 
 		 814 aa  317  5e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  33.39 
 
 		 873 aa  316  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  31.85 
 
 		 891 aa  315  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  38.36 
 
 		 633 aa  312  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  39.83 
 
 		 499 aa  312  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  37.7 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  36.15 
 
 		 527 aa  302  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  37.2 
 
 		 574 aa  302  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.01 
 
 		 587 aa  301  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  36.95 
 
 		 506 aa  300  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  34.62 
 
 		 574 aa  296  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  36.59 
 
 		 526 aa  294  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  37.05 
 
 		 574 aa  294  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  35.8 
 
 		 523 aa  289  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  35.8 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  36.27 
 
 		 495 aa  287  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  37.71 
 
 		 499 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  34.59 
 
 		 526 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  37.5 
 
 		 499 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  36.55 
 
 		 518 aa  283  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  36.55 
 
 		 518 aa  283  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  31.75 
 
 		 822 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  28.67 
 
 		 808 aa  282  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  36.01 
 
 		 528 aa  281  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  36.34 
 
 		 518 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  36.34 
 
 		 518 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  36.84 
 
 		 537 aa  280  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  36.84 
 
 		 537 aa  280  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  36.02 
 
 		 537 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  33.67 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  36.51 
 
 		 535 aa  276  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  37.35 
 
 		 544 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  35.7 
 
 		 585 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  35.49 
 
 		 540 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  29.66 
 
 		 816 aa  271  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  35.56 
 
 		 535 aa  270  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  37.38 
 
 		 534 aa  269  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  45.94 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  35.63 
 
 		 537 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  35.14 
 
 		 568 aa  268  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  35.97 
 
 		 547 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  36.15 
 
 		 505 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  35.62 
 
 		 547 aa  261  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  36.22 
 
 		 525 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  33.4 
 
 		 508 aa  260  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  35.86 
 
 		 504 aa  259  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.1 
 
 		 462 aa  258  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.22 
 
 		 860 aa  257  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  34.01 
 
 		 503 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.05 
 
 		 508 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  34.17 
 
 		 505 aa  255  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  45 
 
 		 518 aa  254  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  35.92 
 
 		 498 aa  253  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  34.69 
 
 		 496 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  34.14 
 
 		 520 aa  251  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  32.58 
 
 		 492 aa  249  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  33.54 
 
 		 496 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  35.17 
 
 		 498 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  44.2 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  34.96 
 
 		 500 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  34.5 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  32.46 
 
 		 522 aa  238  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  31.66 
 
 		 524 aa  236  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  41.53 
 
 		 584 aa  234  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  31.05 
 
 		 523 aa  233  9e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  33.53 
 
 		 527 aa  233  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  33.27 
 
 		 526 aa  232  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  33.54 
 
 		 517 aa  231  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  32.79 
 
 		 511 aa  231  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  34.16 
 
 		 522 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  33.47 
 
 		 520 aa  230  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  32.62 
 
 		 515 aa  230  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>