More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0792 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  100 
 
 
621 aa  1274    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0285  N-6 DNA methylase  37.28 
 
 
634 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  33.71 
 
 
629 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  34.49 
 
 
505 aa  241  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  30.82 
 
 
574 aa  213  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.82 
 
 
587 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  31.42 
 
 
501 aa  210  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  33.17 
 
 
585 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  32.53 
 
 
495 aa  208  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30.13 
 
 
574 aa  206  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  29.62 
 
 
574 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0839  type I restriction-modification system, M subunit, putative  27.64 
 
 
613 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  30.84 
 
 
810 aa  195  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  30.57 
 
 
494 aa  194  5e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  30.5 
 
 
814 aa  191  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  27.55 
 
 
810 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  28.67 
 
 
809 aa  187  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  30.4 
 
 
633 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  31.75 
 
 
499 aa  187  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  32.9 
 
 
493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  28.24 
 
 
499 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  28.84 
 
 
814 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  27.57 
 
 
815 aa  181  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  29.68 
 
 
508 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  29.68 
 
 
523 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  29.05 
 
 
499 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  29.22 
 
 
847 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  28.26 
 
 
495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  29.15 
 
 
799 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  27.57 
 
 
526 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  27.74 
 
 
504 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  28.05 
 
 
808 aa  171  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  27.87 
 
 
506 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  27.25 
 
 
799 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  36.06 
 
 
505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  28.24 
 
 
527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  32.68 
 
 
568 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  28.3 
 
 
505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  27.37 
 
 
891 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.29 
 
 
505 aa  163  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  28.79 
 
 
814 aa  163  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  33.83 
 
 
526 aa  162  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  25.49 
 
 
824 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  27.98 
 
 
496 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  28.54 
 
 
496 aa  160  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  28.47 
 
 
827 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  28.36 
 
 
908 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.53 
 
 
498 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  26.27 
 
 
808 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  35.75 
 
 
527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  27.66 
 
 
816 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  30.13 
 
 
523 aa  150  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.91 
 
 
508 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  30.9 
 
 
873 aa  150  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  27.16 
 
 
822 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  27.92 
 
 
508 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.57 
 
 
708 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  26.87 
 
 
504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.02 
 
 
498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  27.55 
 
 
503 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  27.53 
 
 
500 aa  147  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  28.39 
 
 
871 aa  146  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  32.71 
 
 
680 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.18 
 
 
860 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  27.18 
 
 
492 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  25.45 
 
 
511 aa  133  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.34 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  25.18 
 
 
527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  26.1 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  27.56 
 
 
516 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.48 
 
 
503 aa  131  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  30.12 
 
 
518 aa  131  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  27.84 
 
 
532 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  26.97 
 
 
520 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  26.24 
 
 
515 aa  128  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  26.97 
 
 
520 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  24.69 
 
 
510 aa  127  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 
547 aa  127  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  24.49 
 
 
519 aa  127  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  27.76 
 
 
522 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  24.94 
 
 
521 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.66 
 
 
462 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  28.65 
 
 
519 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  27.05 
 
 
527 aa  124  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  29.4 
 
 
523 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  25.13 
 
 
520 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  27.78 
 
 
576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  29.57 
 
 
520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  28.61 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  28.19 
 
 
523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  28.53 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  29.38 
 
 
534 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  30.91 
 
 
544 aa  122  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  28.01 
 
 
522 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  31.35 
 
 
537 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  29.06 
 
 
518 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  24.34 
 
 
501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  29.06 
 
 
518 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  31.35 
 
 
537 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>