More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3300 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  75.93 
 
 		 538 aa  831    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  61.63 
 
 		 518 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  61.27 
 
 		 532 aa  649    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  65.3 
 
 		 511 aa  666    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 537 aa  1107    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  61.25 
 
 		 517 aa  621  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  58.62 
 
 		 520 aa  604  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  59.14 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  59.14 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  59.2 
 
 		 518 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  55.47 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  55.28 
 
 		 501 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  50 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  50.72 
 
 		 540 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  52.59 
 
 		 527 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  50.65 
 
 		 528 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  52.99 
 
 		 497 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  52.3 
 
 		 521 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  51.52 
 
 		 519 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  50.94 
 
 		 519 aa  501  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  50.09 
 
 		 540 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  52.41 
 
 		 498 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  52.71 
 
 		 514 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  51.26 
 
 		 515 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  51.14 
 
 		 517 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  48.71 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  53.56 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  51.43 
 
 		 544 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  49.06 
 
 		 523 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  46.1 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  49.08 
 
 		 541 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  48.03 
 
 		 576 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  48.25 
 
 		 564 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  47.88 
 
 		 503 aa  474  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  47.16 
 
 		 529 aa  472  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  47.14 
 
 		 570 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  46.03 
 
 		 567 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  48.31 
 
 		 544 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  47.89 
 
 		 529 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  46.39 
 
 		 567 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  47.1 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  47.87 
 
 		 500 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  45.47 
 
 		 569 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  48.35 
 
 		 548 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  48.07 
 
 		 544 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  48 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  46.2 
 
 		 540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  49.62 
 
 		 527 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  50.1 
 
 		 543 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  42.48 
 
 		 849 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  37.38 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  35.83 
 
 		 528 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  35.75 
 
 		 533 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  32.8 
 
 		 510 aa  276  8e-73  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  36.55 
 
 		 495 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  36.55 
 
 		 495 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  34.84 
 
 		 538 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.71 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  36.17 
 
 		 662 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  32.45 
 
 		 529 aa  257  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  34.51 
 
 		 694 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  32.89 
 
 		 495 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  29.5 
 
 		 526 aa  224  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2469  N-6 DNA methylase  33.87 
 
 		 772 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  31.64 
 
 		 633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  31.99 
 
 		 523 aa  213  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  31.99 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.27 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  31.19 
 
 		 574 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  30.78 
 
 		 574 aa  205  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  31.21 
 
 		 505 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  31.19 
 
 		 574 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  29.63 
 
 		 527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  30.42 
 
 		 523 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  30.04 
 
 		 568 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  29.25 
 
 		 522 aa  187  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  30.58 
 
 		 585 aa  186  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  30.97 
 
 		 516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  31.91 
 
 		 814 aa  185  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  30.5 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  31.71 
 
 		 860 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  29.4 
 
 		 709 aa  183  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  32.91 
 
 		 498 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  29.5 
 
 		 511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  30.54 
 
 		 505 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  33.25 
 
 		 498 aa  180  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  32.99 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  28.44 
 
 		 565 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  30.79 
 
 		 822 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3910  N-6 DNA methylase  31.9 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  31.97 
 
 		 815 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  28.11 
 
 		 506 aa  169  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  28.17 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  29.55 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  31.38 
 
 		 808 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  28.54 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  28.34 
 
 		 527 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  31.23 
 
 		 499 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  31.48 
 
 		 824 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>