More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1917 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 673 aa  1309    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1912  N-6 DNA methylase  60.26 
 
 		 691 aa  644    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  47.94 
 
 		 636 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  45.74 
 
 		 675 aa  445  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  44.03 
 
 		 625 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  41.23 
 
 		 677 aa  419  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  41.09 
 
 		 698 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  41.07 
 
 		 680 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  40.34 
 
 		 709 aa  364  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2674  N-6 DNA methylase  41.07 
 
 		 746 aa  347  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559823  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  39.79 
 
 		 626 aa  339  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1349  putative type I restriction system adenine methylase  37.34 
 
 		 558 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  28.53 
 
 		 501 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  27.93 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.05 
 
 		 503 aa  129  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  28.85 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.12 
 
 		 497 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  27.78 
 
 		 525 aa  124  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  27.78 
 
 		 525 aa  124  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  29.71 
 
 		 540 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.86 
 
 		 538 aa  124  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  28.51 
 
 		 511 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  30.09 
 
 		 498 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  27.95 
 
 		 543 aa  122  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.11 
 
 		 548 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  28.99 
 
 		 499 aa  120  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  28.65 
 
 		 527 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  26.35 
 
 		 569 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  25.9 
 
 		 519 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  30.58 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  28.53 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  29.29 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  26.54 
 
 		 500 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  27.8 
 
 		 510 aa  118  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  31.85 
 
 		 519 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  28.85 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  26.94 
 
 		 568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  29.34 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  26 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  27.18 
 
 		 517 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  31.7 
 
 		 532 aa  115  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  27.04 
 
 		 544 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  29.81 
 
 		 775 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.38 
 
 		 549 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  25.93 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  31.08 
 
 		 518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  27.16 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  28.85 
 
 		 520 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  26.13 
 
 		 567 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  27.98 
 
 		 849 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  28.05 
 
 		 809 aa  111  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  28.4 
 
 		 576 aa  111  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  24.09 
 
 		 510 aa  111  5e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  27.76 
 
 		 514 aa  111  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  27.71 
 
 		 518 aa  111  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  26.36 
 
 		 515 aa  111  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  25.78 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  27.38 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.09 
 
 		 544 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 523 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.41 
 
 		 508 aa  108  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.41 
 
 		 523 aa  107  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  27.66 
 
 		 527 aa  107  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  32.04 
 
 		 537 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  29.48 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  27.47 
 
 		 505 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  31.86 
 
 		 494 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  30.97 
 
 		 564 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  31.5 
 
 		 810 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  31.56 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  32.79 
 
 		 574 aa  103  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  29.96 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  31.91 
 
 		 808 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  25.53 
 
 		 567 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  26.05 
 
 		 518 aa  100  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  31.28 
 
 		 585 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  23.49 
 
 		 529 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  25.07 
 
 		 511 aa  99.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  25.47 
 
 		 495 aa  99.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  24.41 
 
 		 529 aa  99  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  31.56 
 
 		 574 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30 
 
 		 574 aa  97.8  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  27.2 
 
 		 522 aa  97.4  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  28.4 
 
 		 518 aa  97.1  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  28.4 
 
 		 518 aa  97.1  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  28.61 
 
 		 505 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  24.29 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  32.4 
 
 		 498 aa  96.3  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 810 aa  96.3  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  24.29 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  29.41 
 
 		 523 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  27.98 
 
 		 518 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  28.87 
 
 		 528 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  27.98 
 
 		 518 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  29.13 
 
 		 799 aa  94.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30.34 
 
 		 860 aa  94.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0369  N-6 DNA methylase  34.35 
 
 		 764 aa  94  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.9 
 
 		 501 aa  94  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  29.78 
 
 		 799 aa  94  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>