22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2510 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2510  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 689 aa  1346    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.746903  normal  0.917843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7557  hypothetical protein  42.39 
 
 		 709 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1101  hypothetical protein  32.4 
 
 		 677 aa  208  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.682215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1097  hypothetical protein  30.12 
 
 		 686 aa  193  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3916  hypothetical protein  33.39 
 
 		 675 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  32.31 
 
 		 680 aa  91.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  27.07 
 
 		 677 aa  90.5  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3079  hypothetical protein  32.85 
 
 		 713 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  27.02 
 
 		 636 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  31.52 
 
 		 626 aa  77.4  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  27.54 
 
 		 673 aa  77  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  27.52 
 
 		 709 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  26.24 
 
 		 625 aa  73.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0033  hypothetical protein  28.34 
 
 		 620 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1349  putative type I restriction system adenine methylase  27.43 
 
 		 558 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1912  N-6 DNA methylase  26.05 
 
 		 691 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  30.35 
 
 		 675 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2674  N-6 DNA methylase  55.1 
 
 		 746 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559823  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  46.43 
 
 		 698 aa  58.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  24.34 
 
 		 661 aa  47.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 527 aa  44.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.86 
 
 		 350 aa  43.9  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>