23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3079 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3079  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1413    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7557  hypothetical protein  28.18 
 
 		 709 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2510  N-6 DNA methylase  28.32 
 
 		 689 aa  88.2  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.746903  normal  0.917843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  29.81 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.49 
 
 		 636 aa  67.4  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1349  putative type I restriction system adenine methylase  56.6 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1912  N-6 DNA methylase  28.42 
 
 		 691 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1097  hypothetical protein  39.36 
 
 		 686 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  28.79 
 
 		 675 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  27.68 
 
 		 625 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0211  N-6 DNA methylase  41.18 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  53.06 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0033  hypothetical protein  30.23 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  43.02 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  53.06 
 
 		 673 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.45 
 
 		 350 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  56.52 
 
 		 680 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1101  hypothetical protein  31 
 
 		 677 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.682215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2674  N-6 DNA methylase  51.79 
 
 		 746 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559823  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  24.5 
 
 		 506 aa  47.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3916  hypothetical protein  35 
 
 		 675 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>