20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7557 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7557  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1394    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2510  N-6 DNA methylase  42.29 
 
 		 689 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.746903  normal  0.917843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1101  hypothetical protein  31.44 
 
 		 677 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.682215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1097  hypothetical protein  29.23 
 
 		 686 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3079  hypothetical protein  27.31 
 
 		 713 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0033  hypothetical protein  27.13 
 
 		 620 aa  99  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3916  hypothetical protein  30.13 
 
 		 675 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  29.31 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  45.71 
 
 		 625 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  27.03 
 
 		 677 aa  58.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  28.64 
 
 		 709 aa  55.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  49.06 
 
 		 675 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1349  putative type I restriction system adenine methylase  36.23 
 
 		 558 aa  51.2  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  41.94 
 
 		 636 aa  50.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  35.29 
 
 		 673 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1912  N-6 DNA methylase  42.59 
 
 		 691 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  42.11 
 
 		 698 aa  47.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  29.9 
 
 		 827 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2674  N-6 DNA methylase  47.73 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559823  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  29.13 
 
 		 691 aa  43.9  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>