103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3075 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  100 
 
 		 1328 aa  2705    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  23.36 
 
 		 1703 aa  145  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  22.82 
 
 		 1697 aa  132  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  30.06 
 
 		 1706 aa  108  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  26.99 
 
 		 1934 aa  108  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  25.52 
 
 		 1932 aa  106  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  24.94 
 
 		 2098 aa  104  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  23.1 
 
 		 2077 aa  97.8  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  26.47 
 
 		 1669 aa  97.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  27.07 
 
 		 1726 aa  95.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  26.04 
 
 		 1669 aa  95.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  26.41 
 
 		 1700 aa  94.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  25.97 
 
 		 1642 aa  93.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  28.46 
 
 		 1649 aa  93.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  23.6 
 
 		 1417 aa  93.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  26.09 
 
 		 1697 aa  92.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  23.86 
 
 		 1722 aa  92  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1748 aa  90.9  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  24.55 
 
 		 1211 aa  89.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  26.09 
 
 		 2005 aa  88.6  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 1516 aa  86.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  25.67 
 
 		 976 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  24.3 
 
 		 1701 aa  84.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  27.42 
 
 		 1956 aa  82.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  23.5 
 
 		 2117 aa  82.4  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  26.49 
 
 		 1925 aa  82.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  22.28 
 
 		 2274 aa  81.6  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  27.44 
 
 		 1575 aa  80.1  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  23.54 
 
 		 2570 aa  79.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  26.36 
 
 		 1693 aa  79.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  25.53 
 
 		 1606 aa  79.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  25.07 
 
 		 1594 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 1702 aa  76.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  25.15 
 
 		 470 aa  73.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 1674 aa  72.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  29.02 
 
 		 577 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  27.44 
 
 		 254 aa  63.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  38.1 
 
 		 1379 aa  59.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  28.38 
 
 		 1080 aa  54.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  28.29 
 
 		 1414 aa  54.3  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  29.89 
 
 		 1134 aa  53.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  32.12 
 
 		 918 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  37.08 
 
 		 1086 aa  53.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  31.39 
 
 		 914 aa  52.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  40.74 
 
 		 763 aa  52.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  37.8 
 
 		 1209 aa  52  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.54 
 
 		 1069 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  24.59 
 
 		 874 aa  50.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  25.21 
 
 		 862 aa  50.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  40.74 
 
 		 1141 aa  50.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  37.35 
 
 		 991 aa  49.3  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  24.75 
 
 		 730 aa  49.3  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  23.79 
 
 		 799 aa  49.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  25.85 
 
 		 871 aa  48.9  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  28.79 
 
 		 1150 aa  48.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 605 aa  48.5  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  42.42 
 
 		 1006 aa  48.5  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  27.65 
 
 		 580 aa  48.5  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  32.91 
 
 		 1088 aa  47.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  24.41 
 
 		 863 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 1108 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 		 1113 aa  48.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  35.62 
 
 		 1113 aa  48.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5290  N-6 DNA methylase  23.36 
 
 		 668 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  20.55 
 
 		 535 aa  47  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1425 aa  47.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  30.6 
 
 		 1096 aa  47  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  40.98 
 
 		 666 aa  46.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  22.38 
 
 		 809 aa  46.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  22.08 
 
 		 528 aa  47  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  32.46 
 
 		 1069 aa  46.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  39.39 
 
 		 1007 aa  46.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  22.82 
 
 		 799 aa  46.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  25.36 
 
 		 808 aa  46.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 810 aa  46.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  24.39 
 
 		 827 aa  47  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  36.76 
 
 		 1070 aa  46.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  23.62 
 
 		 863 aa  46.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.19 
 
 		 1155 aa  46.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 492 aa  46.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1088 aa  46.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1088 aa  45.8  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  37.31 
 
 		 663 aa  45.8  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  40.98 
 
 		 1105 aa  46.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  38.98 
 
 		 958 aa  46.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 		 1068 aa  45.8  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  32.46 
 
 		 1069 aa  45.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 876 aa  45.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 1139 aa  45.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  26.85 
 
 		 1068 aa  45.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  24.02 
 
 		 490 aa  45.4  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  37.88 
 
 		 773 aa  45.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.26 
 
 		 855 aa  45.4  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  20.09 
 
 		 535 aa  45.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32 
 
 		 1091 aa  45.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  39.34 
 
 		 1126 aa  45.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 		 1105 aa  45.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  35.14 
 
 		 924 aa  45.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 		 1104 aa  45.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  22.96 
 
 		 863 aa  45.1  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>