157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1174 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 493 aa  1026    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.35 
 
 		 836 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.42 
 
 		 1432 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  24.49 
 
 		 629 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  25.96 
 
 		 478 aa  103  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.61 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.9 
 
 		 974 aa  99.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  24.47 
 
 		 562 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  24.83 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.74 
 
 		 995 aa  87.8  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1612 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  32.35 
 
 		 595 aa  87  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  23.37 
 
 		 570 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1036 aa  83.6  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  30.81 
 
 		 573 aa  83.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  25.77 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  24.92 
 
 		 673 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  25.81 
 
 		 578 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  25.81 
 
 		 578 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  26.67 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.54 
 
 		 950 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  25.08 
 
 		 1257 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1426 aa  73.6  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1154 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  34.43 
 
 		 1170 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  30.3 
 
 		 604 aa  70.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  25.37 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  25 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  28.37 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  35.04 
 
 		 1186 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  23.48 
 
 		 1159 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  20.22 
 
 		 1147 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  30.54 
 
 		 584 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1299 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1338 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  23.54 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  23.53 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  22.76 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  25.76 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  24.07 
 
 		 1132 aa  63.5  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  35.56 
 
 		 1076 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  26.98 
 
 		 775 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  30.77 
 
 		 1244 aa  62  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  21.22 
 
 		 1209 aa  61.6  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  22.34 
 
 		 908 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  24.51 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  25.64 
 
 		 768 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  26.11 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.85 
 
 		 1194 aa  57.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  22.94 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  27.4 
 
 		 484 aa  57  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  20.89 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2233  hypothetical protein  23.01 
 
 		 544 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  23.18 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1177 aa  56.2  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  27.66 
 
 		 834 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  22 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1209 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.75 
 
 		 694 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  25.2 
 
 		 1285 aa  54.7  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  26.16 
 
 		 247 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  20.98 
 
 		 1041 aa  54.7  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  24.86 
 
 		 746 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  27.5 
 
 		 514 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  24.29 
 
 		 489 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  29.08 
 
 		 1089 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  23.58 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2939  N-6 DNA methylase  25.62 
 
 		 926 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  26.5 
 
 		 508 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  26.21 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  20.65 
 
 		 1058 aa  51.2  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  23.75 
 
 		 508 aa  51.6  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  26.78 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  23.46 
 
 		 505 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  26.5 
 
 		 523 aa  50.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25 
 
 		 1178 aa  50.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  25.37 
 
 		 527 aa  50.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  22.27 
 
 		 1222 aa  50.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  21.63 
 
 		 524 aa  50.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  26.98 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  24.81 
 
 		 1239 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  26.17 
 
 		 792 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  22.46 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  27.13 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  26.84 
 
 		 503 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  23.32 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  19.76 
 
 		 654 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  27.5 
 
 		 1343 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  25.27 
 
 		 517 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1210 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  25.33 
 
 		 553 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  23.78 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  23.16 
 
 		 540 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1120 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  21.85 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  22.51 
 
 		 908 aa  47.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  25.67 
 
 		 511 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  21.79 
 
 		 1560 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>