41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2592 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  96.76 
 
 		 494 aa  977    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1004    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  21.43 
 
 		 950 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  22.07 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  23.19 
 
 		 489 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  20.37 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1125 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  29.73 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  22.97 
 
 		 563 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  23.33 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30.63 
 
 		 484 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  29.06 
 
 		 484 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  22.05 
 
 		 673 aa  50.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 670 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  25.55 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  25.53 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1218 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  29.2 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  22.03 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1241 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  24.11 
 
 		 489 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  25.17 
 
 		 490 aa  47  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  23.4 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  19.18 
 
 		 1162 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  23.36 
 
 		 584 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  28.83 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  21.01 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  21.37 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  25.76 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  28.83 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  22.4 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  24.68 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  20.3 
 
 		 873 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  20.67 
 
 		 573 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  23.64 
 
 		 708 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  32.97 
 
 		 882 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  30.65 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 493 aa  43.9  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  21.7 
 
 		 502 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1324 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>