More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4253 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  52.25 
 
 		 680 aa  694    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 708 aa  1461    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  49.1 
 
 		 670 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  54.72 
 
 		 673 aa  727    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  53.59 
 
 		 728 aa  758    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  51.95 
 
 		 725 aa  738    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  49.93 
 
 		 676 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  50.07 
 
 		 676 aa  695    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  48.95 
 
 		 676 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  46.16 
 
 		 659 aa  623  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  45.44 
 
 		 661 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  45.3 
 
 		 661 aa  622  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  44.63 
 
 		 658 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  44.65 
 
 		 661 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  45.67 
 
 		 686 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  46.08 
 
 		 673 aa  594  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  44.16 
 
 		 683 aa  593  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  45.1 
 
 		 655 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.7 
 
 		 663 aa  565  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  43.72 
 
 		 661 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  44.16 
 
 		 709 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  40.68 
 
 		 777 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  38.88 
 
 		 806 aa  542  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  52.06 
 
 		 580 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  52.23 
 
 		 675 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  39.38 
 
 		 783 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  50.94 
 
 		 611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  42.08 
 
 		 644 aa  512  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  42.12 
 
 		 677 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  49.5 
 
 		 569 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  50.29 
 
 		 607 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  38.74 
 
 		 659 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  37.96 
 
 		 787 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  38.12 
 
 		 793 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  37.98 
 
 		 778 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  36.88 
 
 		 794 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  40.24 
 
 		 710 aa  459  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  37.11 
 
 		 829 aa  458  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  38.67 
 
 		 675 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  45.92 
 
 		 583 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  37.6 
 
 		 675 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  38.07 
 
 		 647 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  44.93 
 
 		 592 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  42.63 
 
 		 586 aa  421  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  36.89 
 
 		 636 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  44.03 
 
 		 587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  44.38 
 
 		 589 aa  405  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  35.38 
 
 		 763 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  36.9 
 
 		 725 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  33.55 
 
 		 691 aa  378  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  40.47 
 
 		 793 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  42.27 
 
 		 790 aa  372  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  41.78 
 
 		 608 aa  365  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  46.17 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  38.14 
 
 		 799 aa  338  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  41.91 
 
 		 552 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  48.32 
 
 		 316 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  28.14 
 
 		 697 aa  191  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  29.96 
 
 		 574 aa  187  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.15 
 
 		 587 aa  177  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  28.6 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30.37 
 
 		 574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.89 
 
 		 633 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  33.15 
 
 		 585 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  28.24 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  30 
 
 		 908 aa  165  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  29.23 
 
 		 510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  29.01 
 
 		 505 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  29.26 
 
 		 523 aa  163  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  29.26 
 
 		 508 aa  163  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.86 
 
 		 822 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  28.14 
 
 		 498 aa  160  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  28.92 
 
 		 495 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.77 
 
 		 505 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  30.24 
 
 		 824 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  52.41 
 
 		 356 aa  153  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  27.29 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  27.88 
 
 		 526 aa  150  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.74 
 
 		 508 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  27.57 
 
 		 500 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  26.57 
 
 		 808 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  29.32 
 
 		 814 aa  147  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  31.23 
 
 		 873 aa  147  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  28.46 
 
 		 522 aa  146  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  29.3 
 
 		 891 aa  145  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  27.36 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  26.94 
 
 		 498 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  29.44 
 
 		 499 aa  143  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  27.87 
 
 		 527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  28.04 
 
 		 516 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  28.45 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  27.67 
 
 		 508 aa  139  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  28.45 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  28.7 
 
 		 516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  27.88 
 
 		 503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  28.44 
 
 		 815 aa  138  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  26.87 
 
 		 540 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  27.79 
 
 		 511 aa  136  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.9 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  27.63 
 
 		 544 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>