60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2709 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2709  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 329 aa  677    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0730  N-6 DNA methylase  79.51 
 
 		 329 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4747  hypothetical protein  60.06 
 
 		 328 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0488  hypothetical protein  59.76 
 
 		 328 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.682666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  59.76 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3311  N-6 DNA methylase  58.36 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4756  hypothetical protein  59.15 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4382  adenine-specific DNA methyltransferase  60.19 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4372  adenine-specific DNA methyltransferase  59.57 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  60.19 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4469  putative adenine-specific DNA methyltransferase  59.15 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4889  hypothetical protein  59.26 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4536  hypothetical protein  59.26 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0559  adenine-specific DNA methylase-like protein  40.29 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1768  hypothetical protein  36.02 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1803  hypothetical protein  36.02 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1276  hypothetical protein  35.6 
 
 		 315 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0854607  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1270  adenine-specific DNA methylase  31.29 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.551057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0167  hypothetical protein  31.99 
 
 		 324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  32.2 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2296  hypothetical protein  34.04 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0468  adenine-specific DNA methylase  28.26 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  28.17 
 
 		 730 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  28 
 
 		 707 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  25.84 
 
 		 846 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  23.58 
 
 		 862 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  21.83 
 
 		 489 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  23.86 
 
 		 486 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  22.48 
 
 		 477 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  24.89 
 
 		 768 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  33.8 
 
 		 605 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  22.54 
 
 		 525 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  24.43 
 
 		 809 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  23.72 
 
 		 493 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  21.85 
 
 		 502 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  22.95 
 
 		 525 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  22.47 
 
 		 863 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.38 
 
 		 680 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  21.01 
 
 		 874 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  26.9 
 
 		 834 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  24.02 
 
 		 481 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  22.73 
 
 		 814 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0330  DNA methylase family protein  24.73 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  26.29 
 
 		 1649 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  22.61 
 
 		 891 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  23.28 
 
 		 853 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  23.45 
 
 		 486 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.59 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.96 
 
 		 673 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  22.17 
 
 		 493 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  23.27 
 
 		 584 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 554 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  20.36 
 
 		 523 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  21.78 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  25.3 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  24.58 
 
 		 570 aa  42.7  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  25.24 
 
 		 505 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3600  N-6 DNA methylase  25.97 
 
 		 738 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  20.1 
 
 		 815 aa  42.4  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  22.01 
 
 		 489 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>