77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1608 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  37.96 
 
 		 1131 aa  809    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  51.53 
 
 		 1183 aa  1164    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  39.11 
 
 		 1160 aa  822    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  57.08 
 
 		 1162 aa  1363    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  51.55 
 
 		 1174 aa  1207    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  100 
 
 		 1182 aa  2451    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  34.85 
 
 		 1180 aa  665    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  36.86 
 
 		 1205 aa  745    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  62.95 
 
 		 1171 aa  1508    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  34.66 
 
 		 1167 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  42.04 
 
 		 1140 aa  908    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  34.64 
 
 		 1144 aa  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  32.25 
 
 		 1219 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  49.72 
 
 		 612 aa  535  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  41.32 
 
 		 1218 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  60.53 
 
 		 332 aa  406  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1270 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1324 aa  268  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1359 aa  265  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1125 aa  243  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1241 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1430 aa  211  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1497 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1484 aa  187  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1162 aa  165  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1326 aa  155  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1141 aa  152  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1154 aa  147  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1154 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1174 aa  144  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1107 aa  142  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  22.27 
 
 		 882 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1129 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  26.31 
 
 		 731 aa  130  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  22.73 
 
 		 706 aa  119  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1425 aa  118  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  31.42 
 
 		 309 aa  86.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.87 
 
 		 995 aa  74.7  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  39.81 
 
 		 106 aa  72.8  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1177 aa  71.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.38 
 
 		 950 aa  70.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  33.62 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.9 
 
 		 1058 aa  68.6  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  26.47 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.6 
 
 		 974 aa  63.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  24.39 
 
 		 1076 aa  60.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  20.26 
 
 		 1178 aa  59.7  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  24.71 
 
 		 1239 aa  58.9  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  21.38 
 
 		 1120 aa  58.5  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.77 
 
 		 1170 aa  56.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  28.42 
 
 		 481 aa  52.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1339 aa  52.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1036 aa  52  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1282 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1147 aa  49.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  42.03 
 
 		 416 aa  48.9  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  24.04 
 
 		 455 aa  48.5  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  28.91 
 
 		 1358 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  28.69 
 
 		 518 aa  48.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  25.33 
 
 		 1338 aa  47  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1154 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  37.68 
 
 		 746 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  29.73 
 
 		 1252 aa  47.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  25.14 
 
 		 1089 aa  46.6  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  25.49 
 
 		 1256 aa  46.6  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  23.91 
 
 		 389 aa  46.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  25.44 
 
 		 584 aa  46.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  25.39 
 
 		 792 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  26.53 
 
 		 562 aa  46.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1209 aa  46.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.59 
 
 		 929 aa  45.8  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  27.11 
 
 		 908 aa  45.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.64 
 
 		 1244 aa  45.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  21.34 
 
 		 1257 aa  45.4  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  40.54 
 
 		 909 aa  45.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  28.72 
 
 		 1222 aa  45.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  25.77 
 
 		 652 aa  45.1  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>