29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0991 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  624  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  54.87 
 
 		 1241 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1270 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1430 aa  86.3  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  29.84 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  28.98 
 
 		 1205 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1359 aa  82.4  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1326 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  27.83 
 
 		 612 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1140 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  27.62 
 
 		 1167 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  26.23 
 
 		 1180 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  28.21 
 
 		 1144 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  23.02 
 
 		 1219 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  23.79 
 
 		 1160 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1131 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1425 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  25.91 
 
 		 1183 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1182 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1174 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1171 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1324 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1162 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1484 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1497 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1218 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1125 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1107 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1141 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>