77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2493 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  55.03 
 
 		 612 aa  667    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  100 
 
 		 1183 aa  2459    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  40.27 
 
 		 1160 aa  887    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  48.76 
 
 		 1162 aa  1078    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  44.49 
 
 		 1174 aa  974    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  51.53 
 
 		 1182 aa  1172    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  39.71 
 
 		 1180 aa  829    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  40.52 
 
 		 1205 aa  841    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  53.32 
 
 		 1171 aa  1200    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  38.68 
 
 		 1167 aa  786    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  39.24 
 
 		 1140 aa  782    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  35.89 
 
 		 1131 aa  689    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  39.85 
 
 		 1144 aa  784    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  32.85 
 
 		 1219 aa  625  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  44.9 
 
 		 1218 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1270 aa  396  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  48.96 
 
 		 332 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1430 aa  240  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1125 aa  235  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1324 aa  232  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1241 aa  210  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1359 aa  202  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1484 aa  197  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  97.03 
 
 		 106 aa  196  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1497 aa  191  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1141 aa  169  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1425 aa  161  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1162 aa  155  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1154 aa  152  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1174 aa  148  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  23.35 
 
 		 882 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1154 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  27.48 
 
 		 731 aa  127  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  22.56 
 
 		 706 aa  125  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1129 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2506  type II restriction enzyme  94.83 
 
 		 72 aa  110  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1326 aa  99  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  32.41 
 
 		 309 aa  90.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1107 aa  84.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.22 
 
 		 1058 aa  73.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  25.12 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.02 
 
 		 995 aa  70.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1178 aa  68.6  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  26.36 
 
 		 300 aa  66.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.97 
 
 		 950 aa  65.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1177 aa  64.7  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.79 
 
 		 974 aa  61.6  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1120 aa  60.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  20.28 
 
 		 1036 aa  57  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  23.36 
 
 		 1239 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  19.86 
 
 		 1020 aa  55.1  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  25 
 
 		 1282 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  25.21 
 
 		 404 aa  52.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  20.71 
 
 		 1132 aa  52.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  41.18 
 
 		 416 aa  51.6  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  22.53 
 
 		 795 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  39.19 
 
 		 1358 aa  52  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  38.46 
 
 		 929 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  27.09 
 
 		 410 aa  50.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1209 aa  51.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  22.01 
 
 		 746 aa  51.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  21.39 
 
 		 1076 aa  50.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  28.91 
 
 		 481 aa  49.7  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  27.96 
 
 		 1252 aa  49.3  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.98 
 
 		 1170 aa  49.3  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  36.49 
 
 		 1338 aa  49.3  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  36.76 
 
 		 1195 aa  47.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  27.96 
 
 		 1244 aa  47  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  20.15 
 
 		 836 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  27.66 
 
 		 1257 aa  47  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  25.6 
 
 		 1847 aa  47.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  28.87 
 
 		 652 aa  46.2  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  30.15 
 
 		 1089 aa  46.2  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  25.33 
 
 		 518 aa  45.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  34.62 
 
 		 694 aa  45.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  22.78 
 
 		 524 aa  45.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  39.13 
 
 		 918 aa  44.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>