105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3043 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  52.25 
 
 		 916 aa  932    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  57.66 
 
 		 914 aa  1030    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  46.23 
 
 		 912 aa  762    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  41.15 
 
 		 933 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  40.8 
 
 		 908 aa  652    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  100 
 
 		 871 aa  1804    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  40.13 
 
 		 928 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  40.54 
 
 		 909 aa  619  1e-176  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  39.01 
 
 		 937 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  37.93 
 
 		 928 aa  582  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  38.02 
 
 		 928 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  37.44 
 
 		 926 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  36.43 
 
 		 926 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  37.66 
 
 		 932 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  40.22 
 
 		 919 aa  570  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  37.34 
 
 		 918 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  37.93 
 
 		 934 aa  531  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.25 
 
 		 929 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  34.41 
 
 		 921 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  34.89 
 
 		 909 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  35.78 
 
 		 929 aa  486  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  34.86 
 
 		 955 aa  462  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  34.73 
 
 		 934 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  32.04 
 
 		 941 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  33.63 
 
 		 622 aa  294  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.26 
 
 		 978 aa  190  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1184 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  27.34 
 
 		 925 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  26.98 
 
 		 918 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1151 aa  176  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  25.78 
 
 		 1186 aa  172  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1173 aa  164  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1188 aa  146  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1018 aa  145  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  29.86 
 
 		 621 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  22.7 
 
 		 973 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1154 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1170 aa  121  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  23.44 
 
 		 869 aa  115  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1346 aa  84.7  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1282 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1347 aa  72  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1353 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1298 aa  68.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1290 aa  68.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1366 aa  66.6  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.17 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1363 aa  63.9  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1452 aa  63.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  23.77 
 
 		 504 aa  63.9  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1440 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1347 aa  62.4  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  25.86 
 
 		 694 aa  60.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  37.21 
 
 		 97 aa  60.1  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  21.29 
 
 		 1409 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  19.13 
 
 		 995 aa  57.8  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  23.96 
 
 		 1002 aa  57  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  20.79 
 
 		 1461 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1339 aa  54.3  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  21.89 
 
 		 536 aa  54.3  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1422 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  24.02 
 
 		 1355 aa  52.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1339 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1339 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  30 
 
 		 1041 aa  51.6  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  30.67 
 
 		 746 aa  51.6  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1243 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  32 
 
 		 1058 aa  51.6  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1333 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1441 aa  50.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 		 1358 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  39.13 
 
 		 1180 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  25.26 
 
 		 1322 aa  50.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1373 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.6 
 
 		 416 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  30 
 
 		 1338 aa  49.7  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1342 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1338 aa  48.9  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  28.33 
 
 		 1331 aa  48.9  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.03 
 
 		 1432 aa  48.5  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1104 aa  48.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  26.95 
 
 		 792 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.52 
 
 		 950 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.36 
 
 		 1076 aa  48.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1321 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1459 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  39.13 
 
 		 1167 aa  47  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  30.07 
 
 		 503 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1210 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1022 aa  47.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1365 aa  47  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1120 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  36.49 
 
 		 1144 aa  46.2  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1359 aa  46.2  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1622  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  45.8  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  39.73 
 
 		 309 aa  45.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1088 aa  45.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1241 aa  45.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  26.62 
 
 		 1189 aa  44.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  28.79 
 
 		 1219 aa  44.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>