57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2250 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  45.63 
 
 		 955 aa  766    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  70.94 
 
 		 934 aa  1341    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  100 
 
 		 929 aa  1910    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  43.46 
 
 		 941 aa  605  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  38.37 
 
 		 933 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  36.55 
 
 		 908 aa  514  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  39.04 
 
 		 928 aa  512  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  36.09 
 
 		 909 aa  495  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  35.78 
 
 		 871 aa  486  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  37.24 
 
 		 934 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  36.79 
 
 		 914 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  37.42 
 
 		 937 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  34.92 
 
 		 916 aa  458  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  34.89 
 
 		 919 aa  453  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  33.55 
 
 		 912 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  33.46 
 
 		 928 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  33.37 
 
 		 926 aa  406  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  33.12 
 
 		 926 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  31.67 
 
 		 921 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  33.03 
 
 		 909 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  31.86 
 
 		 928 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.82 
 
 		 918 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  31.48 
 
 		 932 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.78 
 
 		 929 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  29.08 
 
 		 622 aa  224  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.38 
 
 		 978 aa  156  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  25.83 
 
 		 925 aa  154  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1184 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  25.33 
 
 		 1186 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  24.87 
 
 		 918 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1151 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1188 aa  125  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1018 aa  124  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  26 
 
 		 1154 aa  121  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  26.56 
 
 		 621 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  25.97 
 
 		 973 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1173 aa  108  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1170 aa  92.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  26.17 
 
 		 869 aa  85.9  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1243 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1347 aa  62.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1282 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1346 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1440 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  34.83 
 
 		 97 aa  55.5  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  24.14 
 
 		 694 aa  54.7  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1342 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1290 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1353 aa  52.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  20.42 
 
 		 536 aa  52.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  24.29 
 
 		 490 aa  51.6  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1298 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  23.98 
 
 		 974 aa  49.3  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1125 aa  49.3  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  22.63 
 
 		 416 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  20.28 
 
 		 1210 aa  48.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1461 aa  44.3  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>