56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1309 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  53.06 
 
 		 909 aa  989    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  41.15 
 
 		 871 aa  665    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  39.45 
 
 		 934 aa  700    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  50.7 
 
 		 928 aa  936    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  50.53 
 
 		 937 aa  909    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  51.53 
 
 		 908 aa  968    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  100 
 
 		 933 aa  1946    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  39.2 
 
 		 914 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  38.58 
 
 		 919 aa  602  1e-170  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  38.55 
 
 		 916 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  37.95 
 
 		 912 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  34.75 
 
 		 941 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  37.78 
 
 		 934 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  38.37 
 
 		 929 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  34.75 
 
 		 928 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  35.18 
 
 		 932 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  33.6 
 
 		 928 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  36.9 
 
 		 955 aa  482  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  33.69 
 
 		 926 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  33.65 
 
 		 926 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  33.02 
 
 		 929 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  32.11 
 
 		 909 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  33.33 
 
 		 918 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  32.06 
 
 		 921 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  31.15 
 
 		 622 aa  270  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.95 
 
 		 978 aa  179  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  24.45 
 
 		 1186 aa  162  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1018 aa  161  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1151 aa  161  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1184 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  28.21 
 
 		 925 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  23.55 
 
 		 918 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1154 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1188 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  25.47 
 
 		 621 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1173 aa  134  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1170 aa  132  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  24.96 
 
 		 973 aa  128  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  23.27 
 
 		 869 aa  107  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1282 aa  74.3  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1243 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  41.38 
 
 		 97 aa  71.6  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1290 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1347 aa  55.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  20.28 
 
 		 536 aa  55.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  19.74 
 
 		 694 aa  51.6  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1339 aa  51.2  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1321 aa  51.2  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1622  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  50.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1231 aa  48.9  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  20.55 
 
 		 504 aa  48.9  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25 
 
 		 1298 aa  47.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.87 
 
 		 974 aa  45.8  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  20.18 
 
 		 1342 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1339 aa  45.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1339 aa  45.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>