55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4906 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  45.15 
 
 		 934 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  100 
 
 		 941 aa  1924    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  43.46 
 
 		 929 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  34.76 
 
 		 909 aa  590  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  34.75 
 
 		 933 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  34.62 
 
 		 908 aa  570  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  38.6 
 
 		 937 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  35.99 
 
 		 928 aa  538  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  32.83 
 
 		 934 aa  487  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  30.48 
 
 		 912 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  31.83 
 
 		 919 aa  449  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  36.33 
 
 		 955 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  32.48 
 
 		 916 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  33.45 
 
 		 932 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  32.16 
 
 		 926 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  32.98 
 
 		 926 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  31.65 
 
 		 921 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  32.04 
 
 		 871 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  31.75 
 
 		 914 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  32.05 
 
 		 928 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  30.11 
 
 		 928 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.38 
 
 		 918 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.69 
 
 		 909 aa  362  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.7 
 
 		 929 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  30.98 
 
 		 622 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  23.59 
 
 		 978 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  24.39 
 
 		 925 aa  131  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1018 aa  126  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  26.74 
 
 		 621 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1154 aa  108  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1151 aa  108  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1184 aa  105  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  21.79 
 
 		 1186 aa  97.8  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  25.68 
 
 		 918 aa  95.9  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1170 aa  94.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1188 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1173 aa  90.5  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  25.2 
 
 		 973 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1342 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1321 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1243 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1353 aa  63.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  39.77 
 
 		 97 aa  62.4  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  24.42 
 
 		 869 aa  61.2  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.3 
 
 		 1282 aa  57.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  22.94 
 
 		 512 aa  56.6  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1452 aa  51.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  30 
 
 		 1290 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1339 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1339 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  25 
 
 		 1039 aa  47  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  21.67 
 
 		 536 aa  45.8  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  20.39 
 
 		 1366 aa  45.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  20.77 
 
 		 974 aa  45.1  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  20.09 
 
 		 1347 aa  45.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>