82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4987 on replicon NC_008762
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  44.97 
 
 		 1151 aa  985    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  43.29 
 
 		 1188 aa  941    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  100 
 
 		 1154 aa  2345    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  51.18 
 
 		 1173 aa  1172    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  41.91 
 
 		 1184 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  42.47 
 
 		 869 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  64.65 
 
 		 1170 aa  1493    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  43.97 
 
 		 1186 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  58.21 
 
 		 1018 aa  1157    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  34.31 
 
 		 918 aa  499  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  31.35 
 
 		 925 aa  429  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  31.36 
 
 		 973 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  43.17 
 
 		 430 aa  313  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  33.52 
 
 		 621 aa  304  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  26.45 
 
 		 978 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3224  hypothetical protein  42.69 
 
 		 332 aa  210  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  23.65 
 
 		 919 aa  155  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  25.29 
 
 		 928 aa  146  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  22.35 
 
 		 912 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  22.75 
 
 		 908 aa  142  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  26.07 
 
 		 871 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  26.16 
 
 		 937 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  21.74 
 
 		 934 aa  139  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  20.93 
 
 		 909 aa  139  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1346 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  22.42 
 
 		 933 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  24.11 
 
 		 955 aa  128  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  27.73 
 
 		 916 aa  126  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1243 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1409 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1290 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1441 aa  122  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  26 
 
 		 929 aa  121  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1365 aa  121  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  24.24 
 
 		 934 aa  121  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  28 
 
 		 1440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1282 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  24.49 
 
 		 928 aa  118  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.47 
 
 		 918 aa  116  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  40.53 
 
 		 333 aa  116  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1347 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  25.45 
 
 		 914 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1363 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  24.29 
 
 		 932 aa  110  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1321 aa  109  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1353 aa  109  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.51 
 
 		 909 aa  108  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  24.6 
 
 		 941 aa  108  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.37 
 
 		 926 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1347 aa  105  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  26.15 
 
 		 536 aa  103  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.63 
 
 		 929 aa  102  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1342 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1339 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1339 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1366 aa  96.3  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  22.59 
 
 		 928 aa  93.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  22.17 
 
 		 926 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1461 aa  91.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  23.84 
 
 		 921 aa  90.9  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1452 aa  88.6  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.17 
 
 		 974 aa  77  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  23.39 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1426 aa  60.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1184 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.1 
 
 		 950 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1338 aa  56.2  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1359 aa  56.2  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  29.49 
 
 		 1432 aa  56.2  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1298 aa  55.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  27.4 
 
 		 1319 aa  50.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  21.04 
 
 		 1170 aa  49.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  21.63 
 
 		 1041 aa  49.3  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2741  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  48.9  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  30 
 
 		 1339 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  26.7 
 
 		 1159 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  34 
 
 		 1373 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  24.32 
 
 		 1076 aa  46.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1333 aa  46.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  32.5 
 
 		 1354 aa  45.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1104 aa  45.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  25.59 
 
 		 1189 aa  44.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>