14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3224 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3224  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  682    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  64.58 
 
 		 1188 aa  361  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  52.19 
 
 		 1186 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  51.25 
 
 		 1184 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  46.97 
 
 		 1173 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  45.1 
 
 		 1018 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  42.69 
 
 		 1154 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  40.64 
 
 		 1170 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  41.51 
 
 		 1151 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  28.09 
 
 		 918 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  28.24 
 
 		 621 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  31.25 
 
 		 973 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  33.77 
 
 		 925 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2486  hypothetical protein  27.42 
 
 		 123 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.658764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>