71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0114 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  45.43 
 
 		 1222 aa  966    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  37.41 
 
 		 1208 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  47.59 
 
 		 1233 aa  1071    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  45.95 
 
 		 1195 aa  1021    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  100 
 
 		 1231 aa  2512    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  45.51 
 
 		 1239 aa  954    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  44.2 
 
 		 1209 aa  962    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  42.46 
 
 		 1189 aa  882    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1282 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  24 
 
 		 416 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.95 
 
 		 995 aa  80.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.84 
 
 		 950 aa  75.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1036 aa  67.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1612 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  34.78 
 
 		 1319 aa  63.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1177 aa  60.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  31.29 
 
 		 1322 aa  60.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  32 
 
 		 1002 aa  58.5  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  32.06 
 
 		 1358 aa  58.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1426 aa  57.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1141 aa  57.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1131 aa  58.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  25.36 
 
 		 562 aa  57.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  31.08 
 
 		 1338 aa  58.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.83 
 
 		 1058 aa  57  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  26.33 
 
 		 1180 aa  57.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1459 aa  56.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  30.56 
 
 		 1038 aa  56.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1120 aa  56.2  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  25.6 
 
 		 1167 aa  55.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1125 aa  55.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  23.54 
 
 		 557 aa  54.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  34.21 
 
 		 746 aa  54.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1339 aa  53.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1140 aa  53.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  32 
 
 		 1573 aa  53.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  26.81 
 
 		 1205 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.99 
 
 		 836 aa  53.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  25.81 
 
 		 816 aa  52.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  26.57 
 
 		 795 aa  53.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  26.41 
 
 		 1331 aa  52.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1162 aa  52.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  34.88 
 
 		 1318 aa  52  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  21.46 
 
 		 1432 aa  51.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1173 aa  50.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.53 
 
 		 1170 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  28.05 
 
 		 1219 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  28.63 
 
 		 792 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1422 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  22.76 
 
 		 1132 aa  49.7  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  21.15 
 
 		 1020 aa  49.7  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1575 aa  49.3  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1572 aa  49.3  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  18.45 
 
 		 1076 aa  49.3  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1546 aa  49.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1171 aa  48.5  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1016 aa  48.1  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1231 aa  47.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1243 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1093 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1209 aa  47  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1373 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  32.46 
 
 		 1306 aa  46.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  30.77 
 
 		 1159 aa  46.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1298 aa  45.8  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  32.99 
 
 		 1144 aa  45.8  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  32.46 
 
 		 1355 aa  45.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1154 aa  45.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  34.53 
 
 		 1338 aa  45.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4624  hypothetical protein  26.45 
 
 		 448 aa  45.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  30.37 
 
 		 1219 aa  45.1  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>