70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0193 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  100 
 
 		 684 aa  1371    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.05 
 
 		 995 aa  200  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.36 
 
 		 950 aa  137  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1036 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.35 
 
 		 1058 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.85 
 
 		 1020 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  19.64 
 
 		 836 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  25.06 
 
 		 795 aa  91.3  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  20.7 
 
 		 974 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0993  hypothetical protein  26.73 
 
 		 826 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.24 
 
 		 1170 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.99 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1177 aa  73.6  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  31.58 
 
 		 410 aa  70.5  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  27.04 
 
 		 1041 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1120 aa  65.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  26.62 
 
 		 792 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2492  hypothetical protein  24.09 
 
 		 750 aa  62.4  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  29.6 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1154 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  38.26 
 
 		 1373 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  36.04 
 
 		 1422 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1131 aa  53.9  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  24.12 
 
 		 1257 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1426 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  30.72 
 
 		 1319 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  31.53 
 
 		 404 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  24.12 
 
 		 1244 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  23.16 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1147 aa  51.2  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  28.98 
 
 		 1354 aa  51.2  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1339 aa  50.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  34.15 
 
 		 562 aa  50.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1125 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  22.4 
 
 		 1159 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  28.07 
 
 		 1222 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1209 aa  50.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1333 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1290 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1282 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.95 
 
 		 1338 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1430 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1209 aa  48.9  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  35.37 
 
 		 557 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  33.88 
 
 		 1306 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  29.61 
 
 		 1321 aa  48.5  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1243 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1359 aa  47.4  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  30.63 
 
 		 518 aa  47.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  26.94 
 
 		 1336 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  38.57 
 
 		 309 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  36.47 
 
 		 1160 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1459 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  26.24 
 
 		 768 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  40 
 
 		 732 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  30.77 
 
 		 1712 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  28.66 
 
 		 871 aa  45.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  30.88 
 
 		 746 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  29.69 
 
 		 673 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  34.25 
 
 		 1218 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  34.51 
 
 		 1355 aa  44.3  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  29.26 
 
 		 677 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1195 aa  44.3  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  27.85 
 
 		 1358 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  21.22 
 
 		 1140 aa  44.3  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  29.09 
 
 		 1186 aa  44.3  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  29.73 
 
 		 1318 aa  44.3  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.31 
 
 		 1432 aa  43.9  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  31.13 
 
 		 1180 aa  43.9  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  38.24 
 
 		 1239 aa  43.9  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>