104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3438 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  41.34 
 
 		 1349 aa  953    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  100 
 
 		 1375 aa  2797    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  99.9 
 
 		 1022 aa  2058    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  54.37 
 
 		 1098 aa  1047    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  37.52 
 
 		 1332 aa  798    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.71 
 
 		 1432 aa  241  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1612 aa  237  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.71 
 
 		 1277 aa  226  2e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1250 aa  223  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  22.7 
 
 		 1278 aa  222  3.9999999999999997e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1250 aa  221  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  26.66 
 
 		 1712 aa  204  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  33.41 
 
 		 1426 aa  201  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1459 aa  196  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1339 aa  188  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  23.88 
 
 		 1319 aa  187  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  25.4 
 
 		 1318 aa  179  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  23.79 
 
 		 1322 aa  175  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  25.87 
 
 		 1336 aa  173  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 		 1354 aa  166  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  25.41 
 
 		 1306 aa  164  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  24.97 
 
 		 1338 aa  162  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  25.35 
 
 		 1355 aa  160  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  25.06 
 
 		 1322 aa  154  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  26.45 
 
 		 1358 aa  152  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.62 
 
 		 1331 aa  151  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1581 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1441 aa  149  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  26.85 
 
 		 1219 aa  145  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  25.78 
 
 		 1321 aa  145  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  25.07 
 
 		 1055 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.07 
 
 		 1298 aa  144  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1342 aa  141  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  29.26 
 
 		 1343 aa  141  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1347 aa  139  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1373 aa  137  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  27.32 
 
 		 1442 aa  136  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1409 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1338 aa  133  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1321 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1353 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1363 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1290 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1282 aa  127  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1461 aa  125  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1452 aa  125  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1440 aa  122  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1346 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  34.68 
 
 		 846 aa  115  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1422 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1333 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1709 aa  102  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1243 aa  99.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1572 aa  98.6  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1339 aa  97.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1339 aa  97.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1575 aa  93.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1365 aa  91.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1347 aa  90.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  24.95 
 
 		 1581 aa  81.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.29 
 
 		 1640 aa  81.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1642 aa  80.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1640 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  25 
 
 		 1644 aa  77.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1579 aa  76.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  20.92 
 
 		 1252 aa  76.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1366 aa  76.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.63 
 
 		 1194 aa  74.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  22.89 
 
 		 1256 aa  74.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.91 
 
 		 1573 aa  73.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.69 
 
 		 1257 aa  72  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.69 
 
 		 1244 aa  71.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1557 aa  71.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1546 aa  69.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  26.19 
 
 		 1186 aa  68.6  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1751 aa  68.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  20.54 
 
 		 826 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1177 aa  64.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.65 
 
 		 1020 aa  58.9  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1104 aa  58.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.39 
 
 		 838 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1088 aa  56.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1299 aa  56.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  25.09 
 
 		 882 aa  56.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  25 
 
 		 926 aa  55.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  19.31 
 
 		 1089 aa  54.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1338 aa  53.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2233  hypothetical protein  22 
 
 		 544 aa  52  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  29.66 
 
 		 1041 aa  52  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1039 aa  51.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1154 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1209 aa  49.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  28.46 
 
 		 1170 aa  49.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  23.23 
 
 		 974 aa  49.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1147 aa  48.9  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1178 aa  47.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25.57 
 
 		 1058 aa  48.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  21.32 
 
 		 1076 aa  48.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1210 aa  47.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1195 aa  47.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>