11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2233 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2233  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1106    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  19.69 
 
 		 1250 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  23.01 
 
 		 493 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  22 
 
 		 1375 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  18.94 
 
 		 826 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  23.44 
 
 		 1343 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1709 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  22.61 
 
 		 595 aa  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1250 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  21.67 
 
 		 578 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  21.67 
 
 		 578 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>