22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3411 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  100 
 
 		 247 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  45.98 
 
 		 1132 aa  204  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  42.53 
 
 		 1257 aa  175  6e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  45.75 
 
 		 1159 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1177 aa  125  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  34.07 
 
 		 995 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1120 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  35.86 
 
 		 1076 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1426 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1154 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  33.18 
 
 		 1244 aa  99.4  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  33.48 
 
 		 1299 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  32.72 
 
 		 1338 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1036 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1147 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.73 
 
 		 974 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.66 
 
 		 1432 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  26.16 
 
 		 493 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1612 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  27.59 
 
 		 527 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.42 
 
 		 1058 aa  42.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>