More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2085 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2987  N-6 DNA methylase  71.41 
 
 		 692 aa  986    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2085  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 711 aa  1441    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000172006 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5275  N-6 DNA methylase  29.75 
 
 		 623 aa  266  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0736  N-6 DNA methylase  35.41 
 
 		 725 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0698793  normal  0.0155301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  27.63 
 
 		 506 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  26.08 
 
 		 489 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  25.4 
 
 		 545 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.24 
 
 		 504 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  27.48 
 
 		 553 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  27.96 
 
 		 570 aa  109  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  22.65 
 
 		 527 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  27.15 
 
 		 553 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  24.49 
 
 		 508 aa  108  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  24.38 
 
 		 484 aa  107  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  23.97 
 
 		 506 aa  107  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.34 
 
 		 548 aa  107  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  29.43 
 
 		 505 aa  104  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  25.97 
 
 		 481 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  26.81 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  25.12 
 
 		 493 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  26.5 
 
 		 554 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 512 aa  102  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  23.25 
 
 		 544 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  23.87 
 
 		 544 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  23.87 
 
 		 544 aa  101  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  27.05 
 
 		 775 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  23.3 
 
 		 540 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  27.76 
 
 		 846 aa  99  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  27 
 
 		 524 aa  99  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  26.49 
 
 		 513 aa  98.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  22.05 
 
 		 499 aa  98.6  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  27.24 
 
 		 834 aa  96.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  25.93 
 
 		 489 aa  96.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  27.99 
 
 		 516 aa  95.1  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  25.77 
 
 		 1005 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  25.76 
 
 		 579 aa  92  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  25.51 
 
 		 484 aa  92.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 818 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  22.99 
 
 		 513 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  24.17 
 
 		 563 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  28.12 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  26.96 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  25.56 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  25.86 
 
 		 730 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  24.91 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.68 
 
 		 502 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  29.06 
 
 		 571 aa  81.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  23.41 
 
 		 549 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  29.44 
 
 		 493 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  27.3 
 
 		 493 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  28.09 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  28.11 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  28.09 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.35 
 
 		 703 aa  78.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  26.91 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  25.55 
 
 		 489 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  24.92 
 
 		 489 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  24.06 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  28.05 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  26.75 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  27.31 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  27.86 
 
 		 500 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  25.3 
 
 		 484 aa  73.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  24.19 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  23.64 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  24.61 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  24.92 
 
 		 479 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  28.95 
 
 		 710 aa  72  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  26.64 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 707 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  25.88 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  26.61 
 
 		 481 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  26.13 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  25.99 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  27.8 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  27.8 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  27.8 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  27.8 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  26.39 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  25.32 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  25.65 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  24.77 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  25 
 
 		 873 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 489 aa  67.4  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  26.47 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  24.79 
 
 		 585 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  25.9 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0537  N-6 DNA methylase  21.38 
 
 		 669 aa  65.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  24.78 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  24.92 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  24.8 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0004  N-6 DNA methylase  23.71 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.702722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 		 694 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  28.37 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  25.86 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  27.54 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  23.37 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  23.89 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  25.58 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>