More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1850 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 
489 aa  995    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  60.04 
 
 
522 aa  618  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  62.05 
 
 
520 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  58.43 
 
 
521 aa  580  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  57.43 
 
 
519 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  57.06 
 
 
524 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  56.86 
 
 
526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2182  type I restriction-modification system, M subunit  56.35 
 
 
527 aa  570  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2274  type I restriction-modification system DNA methylase  55.95 
 
 
527 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  54.86 
 
 
517 aa  542  1e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  54.03 
 
 
515 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  55.06 
 
 
523 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  54.75 
 
 
515 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  53.91 
 
 
523 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  54.67 
 
 
523 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  54.23 
 
 
515 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  42.34 
 
 
518 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  40.43 
 
 
528 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  40.93 
 
 
518 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  40.93 
 
 
518 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  40.73 
 
 
518 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  40.73 
 
 
518 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  37.06 
 
 
554 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  38.61 
 
 
547 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  38.46 
 
 
537 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  38.46 
 
 
537 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  37.48 
 
 
540 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  37.26 
 
 
535 aa  326  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  37.5 
 
 
525 aa  326  7e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  37.5 
 
 
525 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  37.84 
 
 
535 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  37.26 
 
 
537 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  37.26 
 
 
537 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  36.22 
 
 
544 aa  316  7e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  38.22 
 
 
534 aa  312  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  36.3 
 
 
584 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.61 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  35.63 
 
 
534 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  36.67 
 
 
547 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  36.64 
 
 
495 aa  286  8e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  36.23 
 
 
501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  33.4 
 
 
494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  33.96 
 
 
862 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  31.87 
 
 
527 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  33.61 
 
 
863 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  33.54 
 
 
863 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  33.26 
 
 
910 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.4 
 
 
855 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  32.8 
 
 
505 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  33.19 
 
 
853 aa  249  8e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  32.44 
 
 
526 aa  249  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  33.19 
 
 
863 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  32.8 
 
 
499 aa  246  6e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  32.64 
 
 
874 aa  246  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  32.78 
 
 
526 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  31.86 
 
 
506 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  33.47 
 
 
856 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  32.74 
 
 
574 aa  240  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  32.47 
 
 
498 aa  237  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  31.6 
 
 
574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  33.05 
 
 
498 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  34.39 
 
 
505 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  31.47 
 
 
499 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  33.55 
 
 
810 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  31.5 
 
 
527 aa  229  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  33.26 
 
 
499 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  31.89 
 
 
496 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  31.43 
 
 
587 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  32.17 
 
 
500 aa  226  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  33.54 
 
 
799 aa  225  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  31.06 
 
 
808 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  30.59 
 
 
871 aa  224  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  32.56 
 
 
810 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  31.93 
 
 
814 aa  224  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  29.85 
 
 
633 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  31.83 
 
 
809 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  30.57 
 
 
495 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  31.34 
 
 
574 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.72 
 
 
860 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  30.34 
 
 
847 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  29.45 
 
 
516 aa  218  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  31.36 
 
 
808 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  31.57 
 
 
799 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  30.74 
 
 
504 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  32.91 
 
 
827 aa  216  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  31.75 
 
 
822 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  30.54 
 
 
505 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  31.67 
 
 
585 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  31.43 
 
 
814 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  31.45 
 
 
891 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  30.8 
 
 
522 aa  212  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.46 
 
 
523 aa  211  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  31.5 
 
 
873 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  30.27 
 
 
815 aa  209  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.26 
 
 
508 aa  209  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  31.82 
 
 
523 aa  209  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  30.89 
 
 
824 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  29.73 
 
 
816 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  30.09 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  36.42 
 
 
908 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>