45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0592 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  69.09 
 
 
224 aa  308  2.9999999999999997e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  65.49 
 
 
227 aa  293  1e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  61.64 
 
 
224 aa  285  4e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  29.89 
 
 
314 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  27.95 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  28 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  32.61 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  29.38 
 
 
364 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  39.52 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  42.35 
 
 
317 aa  62.8  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  37.06 
 
 
346 aa  62  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  29.94 
 
 
351 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  32.28 
 
 
317 aa  62.4  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  33.33 
 
 
334 aa  62  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  34.56 
 
 
344 aa  61.6  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  29.38 
 
 
350 aa  61.6  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  32.74 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  29.3 
 
 
350 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  29.7 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  33.33 
 
 
355 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  40 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  30.24 
 
 
374 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  31.4 
 
 
317 aa  55.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  34.26 
 
 
591 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  40 
 
 
322 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  30 
 
 
475 aa  52.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  27.93 
 
 
499 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  30.77 
 
 
437 aa  48.5  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  31.25 
 
 
389 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  30.97 
 
 
365 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  35.63 
 
 
1697 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  35.63 
 
 
1748 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  36.05 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  32.71 
 
 
1703 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  28.79 
 
 
1697 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  30.28 
 
 
356 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0736  N-6 DNA methylase  29.46 
 
 
725 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0698793  normal  0.0155301 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0744  methyltransferase  39.47 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  31.03 
 
 
336 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  34.62 
 
 
469 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
1516 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  30.87 
 
 
371 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.28 
 
 
235 aa  41.6  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  36.67 
 
 
283 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>