61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2015 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  100 
 
 
314 aa  644    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  49.35 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  30.77 
 
 
344 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  30.39 
 
 
355 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  30.45 
 
 
317 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  28.66 
 
 
317 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  27.76 
 
 
364 aa  95.9  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  33.65 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  33.33 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  33.52 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  30.32 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  32.43 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  36.59 
 
 
310 aa  94  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  34.27 
 
 
346 aa  89.7  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  31.6 
 
 
322 aa  89.7  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  29.48 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  31.61 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  29.89 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  24.39 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  29.55 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  32.1 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  27.23 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  27.32 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  26.2 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  33.94 
 
 
227 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  23.53 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  28.31 
 
 
336 aa  63.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  28.41 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  30.46 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  32.73 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  27.7 
 
 
591 aa  52.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  30.43 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  25.12 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  25.12 
 
 
297 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  25.12 
 
 
317 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  25.12 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  26.92 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  25.25 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  24.14 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  24.14 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  25.95 
 
 
469 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  28.24 
 
 
362 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  31.03 
 
 
437 aa  49.7  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.9 
 
 
368 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  33.33 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  32.48 
 
 
499 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1302  putative RNA methylase  27.63 
 
 
510 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46959  predicted protein  24.33 
 
 
460 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  30.93 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.77 
 
 
947 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.92 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  23.15 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  25.24 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.42 
 
 
372 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.33 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  24.05 
 
 
209 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  32.99 
 
 
259 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  24.09 
 
 
389 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  25.83 
 
 
475 aa  42.4  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.32 
 
 
257 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>