73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0730 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0730  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 329 aa  676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2709  N-6 DNA methylase  79.51 
 
 		 329 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4747  hypothetical protein  54.57 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0488  hypothetical protein  54.27 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.682666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3311  N-6 DNA methylase  53.66 
 
 		 329 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  54.57 
 
 		 328 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4382  adenine-specific DNA methyltransferase  54.94 
 
 		 330 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4889  hypothetical protein  54.01 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4756  hypothetical protein  53.96 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4372  adenine-specific DNA methyltransferase  54.32 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4536  hypothetical protein  54.01 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  54.94 
 
 		 330 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4469  putative adenine-specific DNA methyltransferase  53.35 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0559  adenine-specific DNA methylase-like protein  40.15 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1768  hypothetical protein  34.47 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1803  hypothetical protein  34.47 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1276  hypothetical protein  34.26 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0854607  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1270  adenine-specific DNA methylase  31 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.551057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0167  hypothetical protein  32.92 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  33.68 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2296  hypothetical protein  33.79 
 
 		 312 aa  153  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0468  adenine-specific DNA methylase  32.06 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  26.7 
 
 		 730 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  25.76 
 
 		 707 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  23.35 
 
 		 477 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  21.34 
 
 		 874 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0330  DNA methylase family protein  28.42 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  25.71 
 
 		 554 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  23.05 
 
 		 862 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  35.62 
 
 		 605 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  25.91 
 
 		 489 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 		 673 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  21.93 
 
 		 493 aa  49.3  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.48 
 
 		 489 aa  49.3  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  24.49 
 
 		 673 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  26.03 
 
 		 489 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  24.58 
 
 		 1649 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  25.71 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25.84 
 
 		 809 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  25.58 
 
 		 490 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  22.22 
 
 		 863 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  25.48 
 
 		 479 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  25.45 
 
 		 489 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  24.34 
 
 		 493 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  22.63 
 
 		 910 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  22.22 
 
 		 863 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  24.38 
 
 		 853 aa  46.6  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  23.43 
 
 		 525 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  25.11 
 
 		 626 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  24.27 
 
 		 505 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  24.21 
 
 		 489 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5290  N-6 DNA methylase  32.98 
 
 		 668 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  23.74 
 
 		 698 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  23.91 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  23.77 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  21.74 
 
 		 863 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  23.81 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  25.22 
 
 		 827 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  25.29 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.32 
 
 		 462 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.31 
 
 		 855 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  22 
 
 		 523 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  30.23 
 
 		 625 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  22.65 
 
 		 489 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  27.84 
 
 		 553 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  27.78 
 
 		 553 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  22.69 
 
 		 814 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  23.91 
 
 		 500 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  23.05 
 
 		 492 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 480 aa  42.7  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 808 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  27.04 
 
 		 484 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>