13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0031 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0031  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  940    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0059  hypothetical protein  98.45 
 
 		 453 aa  924    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0062  hypothetical protein  98.23 
 
 		 453 aa  924    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0005  hypothetical protein  98.27 
 
 		 289 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  45.96 
 
 		 658 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  47.44 
 
 		 569 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4528  hypothetical protein  34.23 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103833  normal  0.57888 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0039  hypothetical protein  33.56 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  33.88 
 
 		 1716 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  33.88 
 
 		 1449 aa  67  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  33.88 
 
 		 1457 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6349  hypothetical protein  32.38 
 
 		 310 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2241  hypothetical protein  38.1 
 
 		 304 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>