10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2241 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2241  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0031  hypothetical protein  26.87 
 
 
453 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0059  hypothetical protein  25.99 
 
 
453 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0005  hypothetical protein  35.05 
 
 
289 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0062  hypothetical protein  32.99 
 
 
453 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0039  hypothetical protein  47.83 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4528  hypothetical protein  47.83 
 
 
442 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103833  normal  0.57888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8988  hypothetical protein  25.85 
 
 
358 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6739  hypothetical protein  28.07 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0576965  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  34.07 
 
 
569 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>