14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6739 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6739  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0576965  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8988  hypothetical protein  39.06 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0059  hypothetical protein  24.92 
 
 
453 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  29.17 
 
 
569 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
658 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0031  hypothetical protein  24.58 
 
 
453 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  30.47 
 
 
1716 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0062  hypothetical protein  24.24 
 
 
453 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  30.47 
 
 
1457 aa  46.2  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  30.47 
 
 
1449 aa  46.2  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0005  hypothetical protein  30.4 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6349  hypothetical protein  29.32 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0039  hypothetical protein  30.77 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4528  hypothetical protein  30.77 
 
 
442 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103833  normal  0.57888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>